Development of PainFace software to simplify, standardize, and scale up mouse grimace analyses

比例(比率) 计算机科学 神经科学 计算生物学 生物 地图学 地理
作者
Eric S. McCoy,Sang Kyoon Park,Rahul P. Patel,Dan F. Ryan,Zachary J. Mullen,Jacob J. Nesbitt,Josh E. Lopez,Bonnie Taylor‐Blake,Kelly A. Vanden,James L. Krantz,Wenxin Hu,Rosanna L. Garris,Magdalyn G. Snyder,Lucas Vieira Lima,Susana G. Sotocinal,Jean-Sébastien Austin,Adam D. Kashlan,Sanya Shah,Abigail K. Trocinski,Samhitha S. Pudipeddi
出处
期刊:Pain [Lippincott Williams & Wilkins]
卷期号:165 (8): 1793-1805 被引量:5
标识
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003187
摘要

Abstract Facial grimacing is used to quantify spontaneous pain in mice and other mammals, but scoring relies on humans with different levels of proficiency. Here, we developed a cloud-based software platform called PainFace (http://painface.net) that uses machine learning to detect 4 facial action units of the mouse grimace scale (orbitals, nose, ears, whiskers) and score facial grimaces of black-coated C57BL/6 male and female mice on a 0 to 8 scale. Platform accuracy was validated in 2 different laboratories, with 3 conditions that evoke grimacing—laparotomy surgery, bilateral hindpaw injection of carrageenan, and intraplantar injection of formalin. PainFace can generate up to 1 grimace score per second from a standard 30 frames/s video, making it possible to quantify facial grimacing over time, and operates at a speed that scales with computing power. By analyzing the frequency distribution of grimace scores, we found that mice spent 7x more time in a “high grimace” state following laparotomy surgery relative to sham surgery controls. Our study shows that PainFace reproducibly quantifies facial grimaces indicative of nonevoked spontaneous pain and enables laboratories to standardize and scale-up facial grimace analyses.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
陈东东发布了新的文献求助30
刚刚
不朽阳神完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
我爱科研完成签到 ,获得积分10
1秒前
起床做核酸完成签到,获得积分10
1秒前
小先完成签到,获得积分10
2秒前
搜集达人应助猫猫采纳,获得10
2秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
3秒前
chiahaokuo发布了新的文献求助10
3秒前
4秒前
4秒前
小白菜发布了新的文献求助100
4秒前
hj456完成签到,获得积分10
5秒前
6秒前
迟大猫应助苞大米采纳,获得10
6秒前
6秒前
小二郎应助任伟超采纳,获得10
6秒前
DY发布了新的文献求助10
6秒前
8秒前
8秒前
9秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
9秒前
陈东东完成签到,获得积分10
9秒前
orixero应助ZZJ采纳,获得10
9秒前
风未见的曾经完成签到 ,获得积分10
10秒前
浅辰发布了新的文献求助10
10秒前
傻妞发布了新的文献求助10
10秒前
姜姜完成签到,获得积分10
11秒前
酷酷阑香发布了新的文献求助10
11秒前
12秒前
醉仙发布了新的文献求助10
12秒前
子车茗应助简单的冬瓜采纳,获得20
13秒前
wls完成签到 ,获得积分10
13秒前
13秒前
13秒前
柒柒发布了新的文献求助10
14秒前
嚯嚯完成签到,获得积分20
15秒前
15秒前
言草西完成签到,获得积分10
16秒前
marg发布了新的文献求助10
17秒前
高分求助中
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 2700
Neuromuscular and Electrodiagnostic Medicine Board Review 1000
Statistical Methods for the Social Sciences, Global Edition, 6th edition 600
こんなに痛いのにどうして「なんでもない」と医者にいわれてしまうのでしょうか 510
The Insulin Resistance Epidemic: Uncovering the Root Cause of Chronic Disease  500
Walter Gilbert: Selected Works 500
An Annotated Checklist of Dinosaur Species by Continent 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3663010
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3223738
关于积分的说明 9753126
捐赠科研通 2933645
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1606294
邀请新用户注册赠送积分活动 758404
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 734792