Predict DLBCL patients' recurrence within two years with Gaussian mixture model cluster oversampling and multi-kernel learning

混合模型 布里氏评分 计算机科学 人工智能 支持向量机 聚类分析 核(代数) 过采样 模式识别(心理学) 数学 带宽(计算) 计算机网络 组合数学
作者
Meng Xing,Yanbo Zhang,Hongmei Yu,Zhenhuan Yang,Xueling Li,Qiong Li,Yanlin Zhao,Zhiqiang Zhao,Yanhong Luo
出处
期刊:Computer Methods and Programs in Biomedicine [Elsevier BV]
卷期号:226: 107103-107103 被引量:7
标识
DOI:10.1016/j.cmpb.2022.107103
摘要

Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is common in adults' non-Hodgkin's lymphoma. Relapse mainly occurs within two years after diagnosis and has a poor prognosis. Relapse after two years is less frequent and has a better prognosis. In this work, we constructed a relapse prediction model for diffuse large B-cell lymphoma patients within two years, expecting to provide a reference for Clinicians to implement individualized treatment.We propose a secondary-level class imbalance method based on Gaussian mixture model (GMM) clustering resampling to balance the data. Then use a multi-kernel support vector machine(SVM) to inscribe heterogeneous clinical data. Finally, merging them to identify recurrence patients within two years.Among all the class imbalance methods in this work, Inverse Weighted -GMM +SMOTEENN has the best performance. Compared with NO-GMM (Directl use the SMOTEENN without the GMM clustering process), its Area Under the ROC Curve(AUC) increases by 8.75%, and ECE and brier scores decrease 2.07% and 3.09%, respectively. Among the four classification algorithms in this work, Multiple kernel learning (MKL) has the most minimized brier scores and expected calibration error(ECE), the largest AUC, accuracy, Recall, precision and F1, has the best discrimination and calibration.Our inverse weighted -GMM+SMOTEENN+MKL (GMM-SENN-MKL) method can handle data class imbalance and clinical heterogeneity data well and can be used to predict recurrence in DLBCL patients.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
包容的忆灵完成签到 ,获得积分10
刚刚
1秒前
1秒前
王kk完成签到 ,获得积分10
2秒前
脑洞疼应助chenkm05采纳,获得10
3秒前
合适乐巧完成签到 ,获得积分10
4秒前
JUAN发布了新的文献求助10
6秒前
Reader完成签到 ,获得积分10
7秒前
9秒前
kaifangfeiyao完成签到 ,获得积分10
19秒前
秋风送送完成签到 ,获得积分10
21秒前
22秒前
27秒前
杀出个黎明举报求助违规成功
36秒前
XQQDD举报求助违规成功
36秒前
Strawberry举报求助违规成功
36秒前
36秒前
科研韭菜完成签到 ,获得积分10
37秒前
Annie完成签到 ,获得积分10
38秒前
38秒前
星月完成签到,获得积分10
40秒前
40秒前
笨蛋搞笑女完成签到 ,获得积分10
40秒前
厚德载物完成签到 ,获得积分10
40秒前
杀出个黎明举报求助违规成功
41秒前
XQQDD举报求助违规成功
41秒前
Strawberry举报求助违规成功
41秒前
41秒前
41秒前
44秒前
44秒前
chenkm05完成签到,获得积分10
45秒前
45秒前
46秒前
脑洞疼应助元子采纳,获得10
46秒前
杀出个黎明举报求助违规成功
47秒前
XQQDD举报求助违规成功
47秒前
dew举报求助违规成功
47秒前
47秒前
47秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Development Across Adulthood 800
Chemistry and Physics of Carbon Volume 18 800
The Organometallic Chemistry of the Transition Metals 800
The formation of Australian attitudes towards China, 1918-1941 640
Signals, Systems, and Signal Processing 610
天津市智库成果选编 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 物理 内科学 复合材料 催化作用 物理化学 光电子学 电极 细胞生物学 基因 无机化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6444828
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8258624
关于积分的说明 17591662
捐赠科研通 5504521
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2901561
邀请新用户注册赠送积分活动 1878538
关于科研通互助平台的介绍 1718137