Wangia profunda gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from southern Okinawa Trough deep-sea sediment

黄杆菌科 生物 系统发育树 16S核糖体RNA 细菌 系统发育学 拉伤 分类学(生物学) 动物 微生物学 基因 拟杆菌 遗传学 解剖
作者
Qi‐Long Qin,Dian‐Li Zhao,Jing Wang,Xiu‐Lan Chen,Hongyue Dang,Tiegang Li,Yu‐Zhong Zhang,Peiji Gao
出处
期刊:Fems Microbiology Letters [Oxford University Press]
卷期号:271 (1): 53-58 被引量:56
标识
DOI:10.1111/j.1574-6968.2007.00694.x
摘要

An orange-pigmented, Gram-negative, nonmotile, strictly aerobic and oxidase- and catalase-positive bacterium (SM-A87(T)) was isolated from the deep-sea sediment of the southern Okinawa Trough area. The main fatty acids were i15 : 0, i17 : 0 3OH, i15 : 1 G, i17 : 1 omega 9c, 15 : 0, i15 : 0 3OH and summed feature 3 (comprising i-15 : 0 2OH and/or 16 : 1 omega 7c). MK-6 was the predominant respiratory quinone. DNA G+C content was 35.8 mol%. Flexirubin-type pigments were absent. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain SM-A87(T) formed a distinct lineage within the family Flavobacteriaceae, with <93% sequence similarity to the nearest strain of genus Salegentibacter. Moreover, strain SM-A87(T) could be distinguished from the nearest phylogenetic neighbors by a number of chemotaxonomic and phenotypic properties. On the basis of polyphasic analyses, it is proposed that strain SM-A87(T) be classified in a novel genus and a new species in the family Flavobacteriaceae, designated Wangia profunda gen. nov., sp. nov. The type strain is SM-A87(T) (CCTCC AB 206139(T)=DSM 18752).
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