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Integrated analysis of m6A mRNA methylation in rats with monocrotaline-induced pulmonary arterial hypertension

医学 肺动脉高压 受体 DNA甲基化 RNA甲基化 免疫荧光 甲基转移酶 生物 右心室肥大 甲基化 免疫印迹 内科学 基因 基因表达 内分泌学 分子生物学 信使核糖核酸 生物化学 抗体 免疫学
作者
Yunhong Zeng,Ting Huang,Wanyun Zuo,Dan Wang,Yonghui Xie,Xun Wang,Zhenghui Xiao,Zhi Chen,Qiming Liu,Na Liu,Yunbin Xiao
出处
期刊:Aging [Impact Journals, LLC]
卷期号:13 (14): 18238-18256 被引量:8
标识
DOI:10.18632/aging.203230
摘要

N6-methyladenosine (m6A) modification is one of the most common chemical modifications of eukaryotic mRNAs, which play an important role in tumors and cardiovascular disease through regulating mRNA stability, splicing and translation. However, the changes of m6A mRNA and m6A-related enzymes in pulmonary arterial hypertension (PAH) remain largely unexplored.MeRIP-seq was used to identify m6A methylation in lung tissues from control and MCT-PAH rats. Western blot and immunofluorescence were used to evaluate expression of m6A-related enzymes.Compared with control group, m6A methylation was mainly increased in lung tissues from MCT-PAH rats. The up-methylated coding genes in MCT-PAH rats were primarily enriched in processes associated with inflammation, glycolysis, ECM-receptor interaction and PDGF signal pathway, while genes with down-methylation were enriched in processes associated with TGF-β family receptor members. The expression of FTO and ALKBH5 downregulated, METTL3 and YTHDF1 increased and other methylation modification-related proteins was not significantly changed in MCT-PAH rats lung tissues. Immunofluorescence indicated that expression of FTO decreased and YTHDF1 increased in small pulmonary arteries of MCT-PAH rats.m6A levels and the expression of methylation-related enzymes were altered in PAH rats, in which FTO and YTHDF1 may play a crucial role in m6A modification.
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