Chromatin accessibility dynamics in a model of human forebrain development

前脑 染色质 类有机物 生物 转录因子 大脑发育 人脑 基因表达 基因 发育生物学 神经科学 基因表达调控 计算生物学 遗传学 中枢神经系统
作者
Alexandro E. Trevino,Nasa Sinnott-Armstrong,Jimena Andersen,Se‐Jin Yoon,Nina Huber,Jonathan K. Pritchard,Howard Y. Chang,William J. Greenleaf,Sergiu P. Pașca
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:367 (6476) 被引量:205
标识
DOI:10.1126/science.aay1645
摘要

Organoids recapitulate brain development Gene expression changes and their control by accessible chromatin in the human brain during development is of great interest but limited accessibility. Trevino et al. avoided this problem by developing three-dimensional organoid models of human forebrain development and examining chromatin accessibility and gene expression at the single-cell level. From this analysis, they matched developmental profiles between the organoid and fetal samples, identified transcription factor binding profiles, and predicted how transcription factors are linked to cortical development. The researchers were able to correlate the expression of neurodevelopmental disease risk loci and genes with specific cell types during development. Science , this issue p. eaay1645
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