Identifying drug targets in tissues and whole blood with thermal-shift profiling

全景望远镜 全血 蛋白质组 体内 威罗菲尼 组蛋白脱乙酰酶抑制剂 化学 癌症研究 组蛋白脱乙酰基酶 组蛋白 生物 生物化学 DNA 黑色素瘤 免疫学 生物技术 转移性黑色素瘤
作者
Jessica Perrin,Thilo Werner,Nils Kurzawa,Anna Rutkowska,Dorothee Childs,Mathias Kalxdorf,Daniel Poeckel,Eugenia Stonehouse,Katrin Strohmer,Bianca Heller,Douglas W. Thomson,Jana Krause,Isabelle Becher,H. Christian Eberl,Johanna Vappiani,Daniel C. Sévin,Christina Rau,Holger Franken,Wolfgang Huber,Maria Faelth-Savitski,Mikhail M. Savitski,Marcus Bantscheff,Giovanna Bergamini
出处
期刊:Nature Biotechnology [Springer Nature]
卷期号:38 (3): 303-308 被引量:124
标识
DOI:10.1038/s41587-019-0388-4
摘要

Monitoring drug-target interactions with methods such as the cellular thermal-shift assay (CETSA) is well established for simple cell systems but remains challenging in vivo. Here we introduce tissue thermal proteome profiling (tissue-TPP), which measures binding of small-molecule drugs to proteins in tissue samples from drug-treated animals by detecting changes in protein thermal stability using quantitative mass spectrometry. We report organ-specific, proteome-wide thermal stability maps and derive target profiles of the non-covalent histone deacetylase inhibitor panobinostat in rat liver, lung, kidney and spleen and of the B-Raf inhibitor vemurafenib in mouse testis. In addition, we devised blood-CETSA and blood-TPP and applied it to measure target and off-target engagement of panobinostat and the BET family inhibitor JQ1 directly in whole blood. Blood-TPP analysis of panobinostat confirmed its binding to known targets and also revealed thermal stabilization of the zinc-finger transcription factor ZNF512. These methods will help to elucidate the mechanisms of drug action in vivo.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
陈乐宁2024发布了新的文献求助10
刚刚
大模型应助想念采纳,获得10
刚刚
曲奇饼干发布了新的文献求助20
刚刚
斯文如娆发布了新的文献求助10
刚刚
辰昇一完成签到,获得积分10
1秒前
2秒前
猴猴相聚猩猩相惜完成签到,获得积分10
2秒前
rainbow127完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
大模型应助zz采纳,获得10
3秒前
4秒前
小陆发布了新的文献求助10
4秒前
坚强白玉发布了新的文献求助30
5秒前
共享精神应助咪花嗦采纳,获得10
5秒前
5秒前
毛豆爸爸应助xzh采纳,获得10
5秒前
ding应助小诗采纳,获得10
6秒前
QH完成签到,获得积分10
6秒前
鲁迪完成签到 ,获得积分10
7秒前
8秒前
8秒前
8秒前
ll完成签到,获得积分10
8秒前
9秒前
香蕉觅云应助QH采纳,获得10
9秒前
Lucas应助请问等一会采纳,获得10
10秒前
10秒前
10秒前
10秒前
枝头的小熊猫完成签到 ,获得积分10
10秒前
快乐滑板应助fan采纳,获得10
11秒前
天天快乐应助郑玉成采纳,获得10
11秒前
胡小爱完成签到,获得积分10
12秒前
王俊发布了新的文献求助20
12秒前
常艳艳发布了新的文献求助100
13秒前
13秒前
ngldy发布了新的文献求助10
13秒前
13秒前
afterall发布了新的文献求助10
14秒前
15秒前
高分求助中
Sustainability in Tides Chemistry 2000
Microlepidoptera Palaearctica, Volumes 1 and 3 - 13 (12-Volume Set) [German] 1122
Дружба 友好报 (1957-1958) 1000
The Data Economy: Tools and Applications 1000
A Dissection Guide & Atlas to the Rabbit 600
中国心血管健康与疾病报告2023(要完整的报告) 500
Ожившие листья и блуждающие цветы. Практическое руководство по содержанию богомолов [Alive leaves and wandering flowers. A practical guide for keeping praying mantises] 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3102053
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2753346
关于积分的说明 7623434
捐赠科研通 2406027
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1276521
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 616877
版权声明 599103