Identifying drug targets in tissues and whole blood with thermal-shift profiling

全景望远镜 全血 蛋白质组 体内 威罗菲尼 组蛋白脱乙酰酶抑制剂 化学 癌症研究 组蛋白脱乙酰基酶 组蛋白 生物 生物化学 DNA 黑色素瘤 免疫学 生物技术 转移性黑色素瘤
作者
Jessica Perrin,Thilo Werner,Nils Kurzawa,Anna Rutkowska,Dorothee Childs,Mathias Kalxdorf,Daniel Poeckel,Eugenia Stonehouse,Katrin Strohmer,Bianca Heller,Douglas W. Thomson,Jana Krause,Isabelle Becher,H. Christian Eberl,Johanna Vappiani,Daniel C. Sévin,Christina Rau,Holger Franken,Wolfgang Huber,Maria Faelth-Savitski,Mikhail M. Savitski,Marcus Bantscheff,Giovanna Bergamini
出处
期刊:Nature Biotechnology [Springer Nature]
卷期号:38 (3): 303-308 被引量:124
标识
DOI:10.1038/s41587-019-0388-4
摘要

Monitoring drug-target interactions with methods such as the cellular thermal-shift assay (CETSA) is well established for simple cell systems but remains challenging in vivo. Here we introduce tissue thermal proteome profiling (tissue-TPP), which measures binding of small-molecule drugs to proteins in tissue samples from drug-treated animals by detecting changes in protein thermal stability using quantitative mass spectrometry. We report organ-specific, proteome-wide thermal stability maps and derive target profiles of the non-covalent histone deacetylase inhibitor panobinostat in rat liver, lung, kidney and spleen and of the B-Raf inhibitor vemurafenib in mouse testis. In addition, we devised blood-CETSA and blood-TPP and applied it to measure target and off-target engagement of panobinostat and the BET family inhibitor JQ1 directly in whole blood. Blood-TPP analysis of panobinostat confirmed its binding to known targets and also revealed thermal stabilization of the zinc-finger transcription factor ZNF512. These methods will help to elucidate the mechanisms of drug action in vivo.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
脑洞疼应助君莫惜采纳,获得10
刚刚
美满的砖头完成签到 ,获得积分10
刚刚
碧蓝黑夜发布了新的文献求助10
1秒前
1秒前
2秒前
Sophiaaa完成签到 ,获得积分10
3秒前
活泼学生发布了新的文献求助10
4秒前
elle发布了新的文献求助10
6秒前
abc完成签到,获得积分10
6秒前
meini发布了新的文献求助10
6秒前
cc20231022完成签到,获得积分10
7秒前
传奇3应助Christina采纳,获得10
8秒前
惠耷发布了新的文献求助10
10秒前
lshu文应助吴海彤采纳,获得10
13秒前
Cassie应助cc20231022采纳,获得10
13秒前
飘逸凝丝完成签到 ,获得积分20
13秒前
16秒前
NexusExplorer应助惠耷采纳,获得10
18秒前
南城完成签到 ,获得积分10
18秒前
Christina发布了新的文献求助10
21秒前
LYY应助fifteen采纳,获得10
22秒前
donfern完成签到,获得积分10
26秒前
27秒前
Singularity应助elle采纳,获得10
27秒前
Uniibooy完成签到 ,获得积分10
29秒前
29秒前
violin发布了新的文献求助10
33秒前
shelly完成签到,获得积分10
33秒前
34秒前
duduwind发布了新的文献求助10
34秒前
稳重的若雁应助牛牛采纳,获得10
35秒前
爱静静应助老仙翁采纳,获得10
35秒前
violin完成签到,获得积分10
40秒前
wanci应助机灵自中采纳,获得200
41秒前
慕青应助会飞的姚二狗采纳,获得10
41秒前
42秒前
谦让的振家完成签到,获得积分10
43秒前
Ning_完成签到 ,获得积分10
46秒前
君莫惜给君莫惜的求助进行了留言
47秒前
黑色的白鲸完成签到,获得积分10
47秒前
高分求助中
The Oxford Handbook of Social Cognition (Second Edition, 2024) 1050
Kinetics of the Esterification Between 2-[(4-hydroxybutoxy)carbonyl] Benzoic Acid with 1,4-Butanediol: Tetrabutyl Orthotitanate as Catalyst 1000
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3140361
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2791184
关于积分的说明 7798192
捐赠科研通 2447619
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1301996
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 626354
版权声明 601194