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High-throughput proteomics and metabolomic studies guide re-engineering of metabolic pathways in eukaryotic microalgae: A review

生物制品 代谢组学 代谢工程 代谢途径 蛋白质组学 生化工程 计算生物学 合成生物学 代谢组 生物 生物技术 生物化学 化学 生物信息学 生物燃料 工程类 基因
作者
Hillol Chakdar,Mafruha T. Hasan,Sunil Pabbi,Helena Nevalainen,Pratyoosh Shukla
出处
期刊:Bioresource Technology [Elsevier]
卷期号:321: 124495-124495 被引量:28
标识
DOI:10.1016/j.biortech.2020.124495
摘要

Eukaryotic microalgae are a rich source of commercially important metabolites including lipids, pigments, sugars, amino acids and enzymes. However, their inherent genetic potential is usually not enough to support high level production of metabolites of interest. In order to move on from the traditional approach of improving product yields by modification of the cultivation conditions, understanding the metabolic pathways leading to the synthesis of the bioproducts of interest is crucial. Identification of new targets for strain engineering has been greatly facilitated by the rapid development of high-throughput sequencing and spectroscopic techniques discussed in this review. Despite the availability of high throughput analytical tools, examples of gathering and application of proteomic and metabolomic data for metabolic engineering of microalgae are few and mainly limited to lipid production. The present review highlights the application of contemporary proteomic and metabolomic techniques in eukaryotic microalgae for redesigning pathways for enhanced production of algal metabolites.
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