Genome-wide analysis of the LBD family in rice: Gene functions, structure and evolution

系统发育树 基因 基因组 计算生物学 生物 功能(生物学) 基因家族 功能多样性 蛋白质结构域 进化生物学 领域(数学分析) 系统发育学 遗传学 生态学 数学 数学分析
作者
Zhao Da,Pingli Chen,Chen Zheng,Lijun Zhang,Yansu Wang,Lei Xu
出处
期刊:Computers in Biology and Medicine [Elsevier]
卷期号:153: 106452-106452 被引量:14
标识
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106452
摘要

Recent evidence suggests that LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN (LBD) proteins are involved in different developmental processes of plants. Although the roles of LBD proteins in root development, leaf development and plant defense have been well summarized, their functional diversity and regulation mechanisms are still unclear. One of the reasons for the above problems is the lack of selection and classification of functional protein features of LBD genes. Combined with the existing research results, we found that LBD genes have similar features and mechanics and tend to be in the same phylogenetic branch. Research on the function of the LBD gene can expand our understanding of the diversity and function of LBD proteins. Therefore, to fully understand this large family, it is necessary to review functional studies through in-depth phylogenetic analysis of more genome-available species.
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