Genomic profiling of colorectal cancer in large-scale Chinese patients: amplification and somatic mutations in ERBB2

克拉斯 微卫星不稳定性 结直肠癌 生物 癌症研究 拷贝数变化 基因复制 癌症 表皮生长因子受体 种系突变 体细胞 突变 癌基因 基因 遗传学 微卫星 等位基因 基因组 细胞周期
作者
YUZHI LIU,Evelyne Bischof,Z Chen,JIAHUAN ZHOU,Bei Zhang,Ding Zhang,YONG GAO,Ming Quan
出处
期刊:Oncology Research [Cognizant, LLC]
卷期号:32 (9): 1429-1438
标识
DOI:10.32604/or.2024.047309
摘要

Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-targeted therapies have demonstrated potential benefits for metastatic colorectal cancer (mCRC) patients with HER2 amplification, but are not satisfactory in cases of HER2 mutant CRCs.Consequently, further elucidation of amplifications and somatic mutations in erythroblastic oncogene B-2 (ERBB2) is imperative.Comprehensive genomic profiling was conducted on 2454 Chinese CRC cases to evaluate genomic alterations in 733 cancer-related genes, tumor mutational burden, microsatellite instability, and programmed death ligand 1 (PD-L1) expression.Among 2454 CRC patients, 85 cases (3.46%) exhibited ERBB2 amplification, and 55 cases (2.24%) carried ERBB2 mutation.p.R678Q (28%), p.V8421 (24%), and p.S310F/Y (12%) were the most prevalent of the 16 detected mutation sites.In comparison to the ERBB2 altered (alt) group, KRAS/BRAF mutations were more prevalent in ERBB2 wild-type (wt) samples (ERBB2wt vs. ERBB2alt, KRAS: 50.9% vs. 25.6%,p < 0.05; BRAF: 8.5% vs. 2.3%, p < 0.05).32.7% (18/55) of CRCs with ERBB2 mutation exhibited microsatellite instability high (MSI-H), while no cases with HER2 amplification displayed MSI-H.Mutant genes varied between ERBB2 copy number variation (CNV) and ERBB2 single nucleotide variant (SNV); TP53 alterations tended to co-occur with ERBB2 amplification (92.3%) as opposed to ERBB2 mutation (58.3%).KRAS and PIK3CA alterations were more prevalent in ERBB2 SNV cases (KRAS/PIK3CA: 45.8%/31.2%)compared to ERBB2 amplification cases (KRAS/ PIK3CA: 14.1%/7.7%).Our study delineates the landscape of HER2 alterations in a large-scale cohort of CRC patients from China.These findings enhance our understanding of the molecular features of Chinese CRC patients and offer valuable implications for further investigation.

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