Highly Efficient Quadruped DNA Walker Guided by Ordered DNA Tracks for Rapid and Ultrasensitive Electrochemical Detection of miRNA-21

化学 检出限 DNA 生物传感器 核酸 劈开 组合化学 小RNA 纳米技术 脱氧核酶 计算生物学 生物系统 生物化学 色谱法 基因 材料科学 生物
作者
Tao Yao,Lingqi Kong,Ying Li,Hao Li,Ruo Yuan,Yaqin Chai
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:94 (35): 12256-12262 被引量:20
标识
DOI:10.1021/acs.analchem.2c03083
摘要

Herein, a long period liner DNA tandem (Lr-DNT) was intelligently designed as DNA track for quadruped DNA walker (q-walker) to run in an orderly and efficient manner, which could be applied to construct an electrochemical biosensor for rapid and ultrasensitive detection of microRNA-21 (miRNA-21). Impressively, benefiting from the orderliness and equidistance of Lr-DNT, the q-walker could be endowed with a high controllability, directionality as well as a quite short reaction time down to 20 min compared with those of traditional DNA walkers walked on the stochastic tracks. Once the target miRNA-21 interacted with the locked q-walker, the q-walker could be activated to expeditiously cleave Lr-DNT for releasing amounts of signal probes ferrocene (Fc) with the assistance of the Nt.BbvCI enzyme. This way, the developed q-walker could not only readily overcome the problem of low reaction efficiency but also address the drawback of time consumption in a previous strategy. As a proof of concept, the prepared biosensor could accomplish sensitive detection of target miRNA-21 with a detection limit down to 31 aM. As a result, this tactic gave impetus to design high-performance sensing platform with ultimate application in clinical sample analysis and nucleic acid based cancer diagnostics.
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