A genome and gene catalog of glacier microbiomes

基因组 冰川 基因组 生物 微生物群 基因 进化生物学 生态学 计算生物学 遗传学 古生物学
作者
Yongqin Liu,Mukan Ji,Yu Tao,Julian Zaugg,Alexandre M. Anesio,Zhihao Zhang,Songnian Hu,Philip Hugenholtz,Keshao Liu,Pengfei Liu,Yuying Chen,Yingfeng Luo,Tandong Yao
出处
期刊:Nature Biotechnology [Springer Nature]
卷期号:40 (9): 1341-1348 被引量:74
标识
DOI:10.1038/s41587-022-01367-2
摘要

Glaciers represent a unique inventory of microbial genetic diversity and a record of evolution. The Tibetan Plateau contains the largest area of low-latitude glaciers and is particularly vulnerable to global warming. By sequencing 85 metagenomes and 883 cultured isolates from 21 Tibetan glaciers covering snow, ice and cryoconite habitats, we present a specialized glacier microbial genome and gene catalog to archive glacial genomic and functional diversity. This comprehensive Tibetan Glacier Genome and Gene (TG2G) catalog includes 883 genomes and 2,358 metagenome-assembled genomes, which represent 968 candidate species spanning 30 phyla. The catalog also contains over 25 million non-redundant protein-encoding genes, the utility of which is demonstrated by the exploration of secondary metabolite biosynthetic potentials, virulence factor identification and global glacier metagenome comparison. The TG2G catalog is a valuable resource that enables enhanced understanding of the structure and functions of Tibetan glacial microbiomes.
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