Pseudoroseicyclus tamaricis sp. nov., isolated from seashore sediment of a Tamarix chinensis forest and emended descriptions of the genus Pseudoroseicyclus Park et al. 2016

生物 16S核糖体RNA 植物 系统发育树 拉伤 基因组DNA 微生物学 细菌 基因 解剖 遗传学
作者
Yingbao Gai,Yongpeng Yang,Xiupian Liu,Guangyu Li,Shanshan Wang,Qiliang Lai,Zongze Shao
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:71 (7) 被引量:6
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.004908
摘要

An aerobic, Gram-stain-negative, bacterium, designated CLL3-39 T was isolated from seashore sediment collected at a Tamarix chinensis forest in the Marine Ecology Special Reserve of Changyi, Shandong Province, PR China. Cells of strain CLL3-39 T were olive-shaped and no flagellum was observed. Strain CLL3-39 T grew optimally at 33 °C, pH 7.5 and salinity (sea salts) of 40 g l −1 . The main fatty acids in the cell membrane of strain CLL3-39 T comprised anteiso-C 15 : 0 (22.3 %), iso-C 15 : 0 (14.0 %), C 16 : 0 (9.2 %) and summed feature 8 (contains C 18 : 1 ω 7 c /C 18 : 1 ω 6 c . 26. 7 %). The main polar lipids of CLL3-39 T were phosphatidylglycerol, diphosphatidylglycerol and phosphatidylcholine. The respiratory quinone was Q10. The G+C content of the genomic DNA of strain CLL3-39 T was 69.6 mol%. The average nucleotide identity between CLL3-39 T and Pseudoroseicyclus aestuarii DB-4 T was 74.7 % and the in silico DNA–DNA hybridization value was 20.1 %. Phylogenetically, strain CLL3-39 T belonged to the genus Pseudoroseicyclus , branching with only one type strain P. aestuarii DB-4 T with 96.3 % 16S rRNA gene similarity, followed by Limimaricola cinnabarinus LL-001 T (95.2 %). Based on its phenotypic, phylogenetic and chemotaxonomic characteristics, we propose strain CLL3-39 T (=MCCC 1A14815 T = KCTC 72665 T ) as a representative of a novel species in the genus Pseudoroseicyclus , for which the name Pseudoroseicyclus tamaricis sp. nov. is proposed.

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