Frequency and clinical impact of CDKN2A/ARF/CDKN2B gene deletions as assessed by in-depth genetic analyses in adult T cell acute lymphoblastic leukemia

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作者
Eulàlia Genescà,Aleksey Lazarenkov,Mireia Morgades,Guillem Berbis,Neus Ruiz‐Xivillé,Paula Gómez‐Marzo,Jordi Ribera,Jordi Juncà,Abel González-Pérez,Santiago Mercadal,R. Guardia,M Teresa Artola,María‐José Moreno,Joaquín Martínez‐López,Lurdes Zamora,Pere Barba,Cristina Gil,Mar Tormo,Antònia Cladera,Andrés Novo,Marta Pratcorona,Josep Nomdedéu,José González‐Campos,Maria das Graças Almeida,José Cervera,Pau Montesinos,Montserrat Batlle,Susana Vives,Jordi Esteve,Evarist Feliú,Françesc Solé,Alberto Órfão,Jordi Ribera
出处
期刊:Journal of Hematology & Oncology [Springer Nature]
卷期号:11 (1) 被引量:22
标识
DOI:10.1186/s13045-018-0639-8
摘要

Recurrent deletions of the CDKN2A/ARF/CDKN2B genes encoded at chromosome 9p21 have been described in both pediatric and adult acute lymphoblastic leukemia (ALL), but their prognostic value remains controversial, with limited data on adult T-ALL. Here, we investigated the presence of homozygous and heterozygous deletions of the CDKN2A/ARF and CDKN2B genes in 64 adult T-ALL patients enrolled in two consecutive trials from the Spanish PETHEMA group. Alterations in CDKN2A/ARF/CDKN2B were detected in 35/64 patients (55%). Most of them consisted of 9p21 losses involving homozygous deletions of the CDKNA/ARF gene (26/64), as confirmed by single nucleotide polymorphism (SNP) arrays and interphase fluorescence in situ hybridization (iFISH). Deletions involving the CDKN2A/ARF/CDKN2B locus correlated with a higher frequency of cortical T cell phenotype and a better clearance of minimal residual disease (MRD) after induction therapy. Moreover, the combination of an altered copy-number-value (CNV) involving the CDKN2A/ARF/CDKN2B gene locus and undetectable MRD (≤ 0.01%) values allowed the identification of a subset of T-ALL with better overall survival in the absence of hematopoietic stem cell transplantation.
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