Photoaffinity labelling-based chemoproteomic strategy identifies PEBP1 as the target of ethyl gallate against macrophage activation

分子生物学 核化学 生物 生物化学 化学
作者
Yu Wei,M. Liao,Yang Chen,Rui Xue,Xiaomeng Shi,Dan Liu,Fang-Fang Zhuo,Hui Tang,Zhiyuan Lu,Pengfei Tu,Bo Han,Xin Jia,Ke‐Wu Zeng
出处
期刊:Chemical Communications [The Royal Society of Chemistry]
卷期号:59 (8): 1022-1025 被引量:2
标识
DOI:10.1039/d2cc05440j
摘要

Ulcerative colitis (UC) is an inflammatory disease of the colon with an unmet need for therapeutic targets. Ethyl gallate (EG) is a natural small molecule for UC treatment, but its cellular target is unknown. By labelling EG with a diazirine photocrosslinker and a click chemistry handle, we identified phosphatidyl-ethanolamine binding protein1 (PEBP1) as a direct cellular target of EG by forming hydrogen bonds with Asp70 and Tyr120. In particular, hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry indicated that EG induced the sequence (residues 141-153) embedding to inhibit S153 phosphorylation of PEBP1. Additionally, the EG-mediated sequence (residues 108-122) exposure significantly enhanced PEBP1-Raf-1 interaction to block the downstream NF-κB inflammatory pathway in macrophages. Moreover, PEBP1 siRNA substantially reversed the EG-dependent down-regulation of the phosphorylation of IKKβ, IκBα and NF-κB, demonstrating that the NF-κB signal functioned as an essential anti-inflammation mechanism of PEBP1. Collectively, we revealed PEBP1 as a previously undescribed cellular target in macrophages for UC therapy and identified a new allosteric site for PEBP1 biology study using EG as a chemical probe.
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