Comprehensive Analysis of circRNA Expression Profiles in Human Brown Adipose Tissue

褐色脂肪组织 下调和上调 生物 白色脂肪组织 脂肪组织 计算生物学 细胞生物学 分子生物学 基因 遗传学 生物化学
作者
Xinghuai Sun,Xinxing Wan,Md. Asaduzzaman Khan,Keke Zhang,Yi Xuan,Zhouqi Wang,Ke Chen
出处
期刊:Diabetes, Metabolic Syndrome and Obesity: Targets and Therapy [Dove Medical Press]
卷期号:Volume 16: 469-478 被引量:1
标识
DOI:10.2147/dmso.s398620
摘要

Brown adipose tissue (BAT) can rapidly generate heat and improve energy metabolism. Circular RNAs (circRNAs) are cellular endogenous non-coding RNAs, which can regulate the development and progress of different diseases. However, the role of circRNAs in human BAT is not fully understood. Here, we analyzed the differentially expressed circRNAs (DECs) in human BAT, as well as in white adipose tissue (WAT), and identified new biomarkers of BAT.Three human BAT and three human subcutaneous WAT samples were selected, and circRNA microarray was performed. Additionally, quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) was applied to determine the expression of six circRNAs. Finally, the functional analysis was performed by bioinformatics.Compared to WAT, 152 upregulated circRNAs and 201 downregulated circRNAs were identified in BAT. The DECs were further subjected to GO and KEGG enrichment analysis. Several circRNAs, for example, hsa_circ_0006168, hsa_circ_26337 and hsa_circ_0007507 were found upregulated and hsa_circ_0030162 was found downregulated in human BAT compared to WAT.This study profiles the circRNA expression in human BAT and WAT, and suggests hsa_circ_0006168, hsa_circ_26337, hsa_circ_0007507, and hsa_circ_0030162 as novel biomarkers for human BAT.
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