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The shikimate pathway: gateway to metabolic diversity

莽草酸途径 网关(网页) 生物化学 多样性(政治) 代谢途径 计算生物学 生物 基因 计算机科学 万维网 社会学 生物合成 人类学
作者
Vikram V. Shende,Katherine D. Bauman,Bradley S. Moore
出处
期刊:Natural Product Reports [The Royal Society of Chemistry]
卷期号:41 (4): 604-648 被引量:22
标识
DOI:10.1039/d3np00037k
摘要

Covering: 1997 to 2023The shikimate pathway is the metabolic process responsible for the biosynthesis of the aromatic amino acids phenylalanine, tyrosine, and tryptophan. Seven metabolic steps convert phosphoenolpyruvate (PEP) and erythrose 4-phosphate (E4P) into shikimate and ultimately chorismate, which serves as the branch point for dedicated aromatic amino acid biosynthesis. Bacteria, fungi, algae, and plants (yet not animals) biosynthesize chorismate and exploit its intermediates in their specialized metabolism. This review highlights the metabolic diversity derived from intermediates of the shikimate pathway along the seven steps from PEP and E4P to chorismate, as well as additional sections on compounds derived from prephenate, anthranilate and the synonymous aminoshikimate pathway. We discuss the genomic basis and biochemical support leading to shikimate-derived antibiotics, lipids, pigments, cofactors, and other metabolites across the tree of life.
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