CRISPR/Cas9-mediated genome editing in Penicillium oxalicum and Trichoderma reesei using 5S rRNA promoter-driven guide RNAs

清脆的 基因组编辑 里氏木霉 生物 发起人 遗传学 DNA 黑曲霉 核糖核酸 基因组 计算生物学 基因 基因表达 生物化学 生物技术 纤维素酶
作者
Qi Wang,Qinqin Zhao,Qin Liu,Xin He,Yaohua Zhong,Yuqi Qin,Liwei Gao,Guodong Liu,Yinbo Qu
出处
期刊:Biotechnology Letters [Springer Nature]
卷期号:43 (2): 495-502 被引量:19
标识
DOI:10.1007/s10529-020-03024-7
摘要

To construct convenient CRISPR/Cas9-mediated genome editing systems in industrial enzyme-producing fungi Penicillium oxalicum and Trichoderma reesei. Employing the 5S rRNA promoter from Aspergillus niger for guide RNA expression, the β-glucosidase gene bgl2 in P. oxalicum was deleted using a donor DNA carrying 40-bp homology arms or a donor containing no selectable marker gene. Using a markerless donor DNA as editing template, precise replacement of a small region was achieved in the creA gene. In T. reesei, the A. niger 5S rRNA promoter was less efficient than that in P. oxalicum when used for gene editing. Using a native 5S rRNA promoter, stop codons were introduced into the lae1 coding region using a markerless donor DNA with an editing efficiency of 36.67%. Efficient genome editing systems were developed in filamentous fungi P. oxalicum and T. reesei by using heterologous or native 5S rRNA promoters for guide RNA expression.
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