Contrastive and uncertainty-aware nuclei segmentation and classification

分割 计算机科学 人工智能 模式识别(心理学) 自然语言处理 机器学习
作者
Wenxi Liu,Q Zhang,Qi Li,Shu Wang
出处
期刊:Computers in Biology and Medicine [Elsevier]
卷期号:: 108667-108667
标识
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108667
摘要

Nuclei segmentation and classification play a crucial role in pathology diagnosis, enabling pathologists to analyze cellular characteristics accurately. Overlapping cluster nuclei, misdetection of small-scale nuclei, and pleomorphic nuclei-induced misclassification have always been major challenges in the nuclei segmentation and classification tasks. To this end, we introduce an auxiliary task of nuclei boundary-guided contrastive learning to enhance the representativeness and discriminative power of visual features, particularly for addressing the challenge posed by the unclear contours of adherent nuclei and small nuclei. In addition, misclassifications resulting from pleomorphic nuclei often exhibit low classification confidence, indicating a high level of uncertainty. To mitigate misclassification, we capitalize on the characteristic clustering of similar cells to propose a locality-aware class embedding module, offering a regional perspective to capture category information. Moreover, we address uncertain classification in densely aggregated nuclei by designing a top-k uncertainty attention module that leverages deep features to enhance shallow features, thereby improving the learning of contextual semantic information. We demonstrate that the proposed network outperforms the off-the-shelf methods in both nuclei segmentation and classification experiments, achieving the state-of-the-art performance.
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