Contemporary bioinformatics and cheminformatics support for food peptidomics

化学信息学 工作流程 计算机科学 数据科学 集合(抽象数据类型) 质量(理念) 蛋白质组学 生物技术 生物信息学 计算生物学 生物 数据库 生物化学 哲学 认识论 基因 程序设计语言
作者
Piotr Mińkiewicz,Anna Iwaniak,Małgorzata Darewicz
出处
期刊:Current opinion in food science [Elsevier]
卷期号:56: 101125-101125 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.cofs.2024.101125
摘要

The aim of this publication is to discuss role and examples of applications and challenges for computer tools applied in food peptidomics, research area merging proteomics and metabolomics, focused on the entire set of peptides in a raw material or product. It encompasses the characterization of a peptidome, its properties, bioactivity and fate during digestion or technological processes. Bioinformatics and cheminformatics tools serve to support all steps of workflow. They are necessary because the number of peptides possibly present in peptidomes is too big to be characterized by experiments only. On the other hand, only experiments can provide data enabling the development of programs. Tools for work on peptides are available via metabases and metaservers, i.e. websites offering access to multiple databases or programs. New tools are launched every year, while the others cease to exist. Ensuring the quality and continuity of operation of computer tools is also a challenge.
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