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Photo‐crosslinking: An Emerging Chemical Tool for Investigating Molecular Networks in Live Cells

相互作用体 二苯甲酮 背景(考古学) 叠氮化物 化学 质谱法 蛋白质功能 组合化学 生物物理学 纳米技术 生物化学 材料科学 生物 光化学 有机化学 色谱法 基因 古生物学
作者
Pratyush Kumar Mishra,Chang‐Mo Yoo,Eunmi Hong,Hyun‐Woo Rhee
出处
期刊:ChemBioChem [Wiley]
卷期号:21 (7): 924-932 被引量:50
标识
DOI:10.1002/cbic.201900600
摘要

Abstract Studying protein–protein interactions (PPIs) is useful for understanding cellular functions and mechanisms. Evaluating these PPIs under conditions as similar as possible to native conditions can be achieved using photo‐crosslinking methods because of their on‐demand ability to generate reactive species in situ by irradiation with UV light. Various fusion tag, metabolic incorporation, and amber codon suppression approaches using various crosslinkers containing aryl azide, benzophenone, and diazirines have been applied in live cells. Mass spectrometry and immunological techniques are used to identify crosslinked proteins based on their capture transient and context‐dependent interactions. Herein we discuss various incorporation methods and crosslinkers that have been used for interactome mapping in live cells.
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