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Phylogenetic Relationships of Mushroom Agrocybe spp. Based on rDNA-ITS Analysis

生物 系统发育树 蘑菇 内转录区 植物 核糖体DNA 核糖体RNA 系统发育关系 遗传学 基因
作者
Jong-Chun Cheong,Myung Chul Lee,Kab-Yeul Jang,Chang-Sung Jhune,Chan-Jung Lee
出处
期刊:The Korean Journal of Mycology [The Korean Society of Mycology]
卷期号:37 (1): 11-18
标识
DOI:10.4489/kjm.2009.37.1.011
摘要

볏짚버섯속(Agrocybe sp.) 균의 분자생물학적 유연관계분석을 통한 종(species) 구분을 위하여 국립원예특작과학원 버섯과에 보존중인 ASI $19001{\sim}19032$중 30균주를 공시하고 rDNA의 ITS영역 염기서열을 비교하였다. 그 결과, ASI 19007, 19016, 19019, 19020, 19022, 19023, 19024, 19025, 19027, 19028, 19031, 19032 등 12균주가 A. chaxingu; ASI 19021, 19026 등 2균주가 A. salicacola; ASI 19002, 19003, 19004, 19005, 19029 등 5균주가 A. cylindracea; 19001, 19010, 19011, 19012, 19013, 19015등 6균주가 A. erebia; 그리고 ASI 19008; ASI 19017과 19018; ASI 19009; ASI 19014 등 8그룹으로 구분되었다. 이 결과는 기존의 톱밥병재배 시험에서 자실체가 발생한 18균주 중에서 버섯 발생이 잘 되었던 ASI 19003 등 5균주(A. cylindracea)와 ASI 19007 등 10균주(A. chaxingu), ASI 19026 등 2균주(A. salicacola)는 균의 배양속도, 자실체의 발생과 생육기간등 재배적 특성으로 그룹(Species 수준) 간에 구분이 뚜렷 하였는데, 이는 본 시험의 분지도에 나타난 A. chaxingu, A. cylindracea의 구분 결과와 일치하였다. 따라서 rDNA ITS 영역의 염기서열분석은 Agrocybe속 버섯의 종 구분에 있어서 선행적, 보충적 수단으로 활용하기에 충분하다고 판단된다. 또한 본 시험 등에서 조사한 볏짚버섯속 균주들의 특성과 종 구분을 통하여 육종 모본 선발 및 균의 특성에 맞는 재배관리와 소비자 기호에 알맞은 균주의 선택등이 가능할 것으로 기대된다. Phylogenetic relationships were investigated in the mushroom genus Agrocybe based on sequence data from the internal transcribed spaces(ITS) of nuclear ribosomal DNA(rDNA). Thirty strains including Agrocybe aegerita, A. grocybe cylindracea, A. grocybe praecox, A. grocybe pediades and Unknown Agrocybe species were subjected for the analysis. The Agrocybe spp. were separated into eight distinct groups. Phylogenetic analysis divided these species into eight groups as follows: A. chaxingu within group I, A. salicacola within group II, A. cylindracea and A. aegerita within group III, Agrocybe sp. within group IV and V, and other Agrocybe spp. were grouped within VI, VII, and VIII.

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