Bacteriophage Taxonomy: A Continually Evolving Discipline

分类学(生物学) 病毒分类 生物 原核生物 基因组 噬菌体 进化生物学 系统发育学 遗传学 动物 基因 大肠杆菌
作者
Dann Turner,Evelien M. Adriaenssens,Susan M. Lehman,Cristina Moraru,Andrew M. Kropinski
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 27-45 被引量:9
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_3
摘要

While taxonomy is an often underappreciated branch of science, it serves very important roles. Bacteriophage taxonomy has evolved from a discipline based mainly on morphology, characterized by the work of David Bradley and Hans-Wolfgang Ackermann, to the sequence-based approach that is taken today. The Bacterial Viruses Subcommittee of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) takes a holistic approach to classifying prokaryote viruses by measuring overall DNA and protein similarity and phylogeny before making decisions about the taxonomic position of a new virus. The huge number of complete genomes being deposited with the National Center for Biotechnology Information (NCBI) and other public databases has resulted in a reassessment of the taxonomy of many viruses, and the future will see the introduction of new viral families and higher orders.
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