Individual feed efficiency in fishes : direct measurement methods and indirect predictors to develop selective breeding programs in two major aquaculture species : European sea bass Dicentrarchus labrax and Nile tilapia Oreochromis niloticus

L’aliment utilise en pisciculture est onereux et impacte l’environnement. Ameliorer l’efficacite alimentaire (EA) pour produire la meme quantite de poisson en utilisant moins d’aliment est un objectif majeur pour rendre l’aquaculture plus durable. Cet objectif pourrait etre atteint grâce a la selection genetique, mais cela necessite des methodes de phenotypage individuel, et mesurer la prise alimentaire individuelle est complexe chez le poisson. Les deux meilleures methodes, a l’heure actuelle, consistent soit a elever les poissons individuellement, soit a les marquer avec un tag externe pour les identifier visuellement au sein de petits groupes. Je me suis focalise sur des questions d’importance critique en lien avec l’estimation de l’EA individuelle, chez deux especes aquacoles majeures, le bar Europeen Dicentrarchus labrax et le tilapia du Nile Oreochromis niloticus. J’ai demontre qu’estimer l’EA individuelle au stade juvenile chez le tilapia du Nil permettait de predire l’EA sur l’ensemble du cycle de production. Ensuite, j’ai compare les deux methodes de phenotypage chez le tilapia du Nil, et observe qu’elles ne fournissent pas des estimations equivalentes. Enfin, j’ai aussi constate que les poissons les plus efficaces a taux de rationnement restreint n’etaient pas les plus efficaces a satiete, chez les deux especes.Les deux methodes de phenotypage demeurent, cependant, fastidieuses. J’ai, en consequence, cherche de potentiels criteres de selection indirecte qui soient plus faciles a mesurer. Chez le bar europeen, il n’y avait pas de correlation entre l’EA individuelle et le taux metabolique individuel (estime par la consommation d’oxygene). Par ailleurs, j’ai resolu des problemes d’ordre methodologique afin d’implementer l’analyse de la signature isotopique, grâce a l’echantillonnage non letal des ecailles, en tant que critere de selection indirecte.Pour conclure, selectionner les poissons au stade juvenile semble fiable et permettra de reduire les couts de selection. La methode de phenotypage de l’EA individuelle a utiliser pour faire de la selection genetique depend, cependant, de l’espece. En particulier, la structure sociale de l’espece doit etre prise en compte dans le choix de la methode la plus appropriee. En outre, les poissons devraient etre phenotypes dans des conditions d’elevage et de nourrissage aussi proches que possible de celles en elevage commercial. Le taux metabolique pourrait etre utilisable en tant que critere de selection indirecte si couple avec des mesures de l’excretion d’ammoniac ou de la composition corporelle. Quant a l’analyse de la signature isotopique des ecailles, elle est techniquement realisable et necessite d’etre plus amplement etudiee.