To incise or not and where: SET-domain methyltransferases know

H3K4me3 组蛋白甲基转移酶 表观遗传学 组蛋白密码 染色质 组蛋白 表观遗传学 生物 EZH2型 遗传学 组蛋白H3 甲基转移酶 计算生物学 组蛋白甲基化 细胞生物学 DNA 基因 发起人 DNA甲基化 基因表达 核小体 甲基化
作者
Michelle N. Yancoskie,Corina Maritz,Patrick van Eijk,Simon H. Reed,Hanspeter Naegeli
出处
期刊:Trends in Biochemical Sciences [Elsevier]
卷期号:48 (4): 321-330 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.tibs.2022.10.003
摘要

The concept of the histone code posits that histone modifications regulate gene functions once interpreted by epigenetic readers. A well-studied case is trimethylation of lysine 4 of histone H3 (H3K4me3), which is enriched at gene promoters. However, H3K4me3 marks are not needed for the expression of most genes, suggesting extra roles, such as influencing the 3D genome architecture. Here, we highlight an intriguing analogy between the H3K4me3-dependent induction of double-strand breaks in several recombination events and the impact of this same mark on DNA incisions for the repair of bulky lesions. We propose that Su(var)3–9, Enhancer-of-zeste and Trithorax (SET)-domain methyltransferases generate H3K4me3 to guide nucleases into chromatin spaces, the favorable accessibility of which ensures that DNA break intermediates are readily processed, thereby safeguarding genome stability.
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