The therapeutic landscape for cells engineered with chimeric antigen receptors

嵌合抗原受体 受体 临床试验 范围(计算机科学) 医学 免疫学 计算生物学 生物信息学 生物 计算机科学 免疫疗法 免疫系统 遗传学 程序设计语言
作者
Matthew MacKay,Ebrahim Afshinnekoo,Jonathan Rub,Ciaran Hassan,Mihir Khunte,Nithyashri Baskaran,Bryan Owens,Lauren P. Liu,Gail J. Roboz,Mónica L. Guzmán,Ari Melnick,Shixiu Wu,Christopher E. Mason
出处
期刊:Nature Biotechnology [Springer Nature]
卷期号:38 (2): 233-244 被引量:171
标识
DOI:10.1038/s41587-019-0329-2
摘要

Despite the global rapid increase in the number of clinical trials employing chimeric antigen receptors (CARs), no comprehensive survey of their scope, targets and design exists. In this study, we present an interactive CAR clinical trial database, spanning 64 targets deployed in T cells (CAR-T), natural killer cells (CAR-NK) or mixtures (CAR-NK/T) from over 500 clinical trials in 20 countries, encompassing >20,000 patients. By combining these data with transcriptional and proteomic data, we create a 'targetable landscape' for CAR cell therapies based on 13,206 proteins and RNAs across 78 tissues, 124 cell types and 20 cancer types. These data suggest a landscape of over 100 single targets and over 100,000 target pairs using logical switches for CAR cell engineering. Our analysis of the CAR cellular therapeutic landscape may aid the design of future therapies, improve target-to-patient matching, and ultimately help inform our understanding of CAR therapy's safety and efficacy.
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