Chemometrics in Metabonomics

化学计量学 主成分分析 偏最小二乘回归 计算机科学 OPL公司 数据挖掘 人工智能 模式识别(心理学) 机器学习 化学 计算化学 分子动力学 水模型
作者
Johan Trygg,Elaine Holmes,Torbjörn Lundstedt
出处
期刊:Journal of Proteome Research [American Chemical Society]
卷期号:6 (2): 469-479 被引量:1229
标识
DOI:10.1021/pr060594q
摘要

We provide an overview of how the underlying philosophy of chemometrics is integrated throughout metabonomic studies. Four steps are demonstrated: (1) definition of the aim, (2) selection of objects, (3) sample preparation and characterization, and (4) evaluation of the collected data. This includes the tools applied for linear modeling, for example, Statistical Experimental Design (SED), Principal Component Analysis (PCA), Partial least-squares (PLS), Orthogonal-PLS (OPLS), and dynamic extensions thereof. This is illustrated by examples from the literature. Keywords: Statistical Experimental Design (SED) • PCA • OPLS • Class-specific studies • Dynamic studies • Multivariate Design
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