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High‐Throughput Metabolomics by 1D NMR

代谢组学 代谢组 化学计量学 鉴定(生物学) 计算生物学 人口 生物 生化工程 化学 生物信息学 色谱法 医学 工程类 生态学 环境卫生
作者
Alessia Vignoli,Veronica Ghini,Gaia Meoni,Cristina Licari,Panteleimon G. Takis,Leonardo Tenori,Paola Turano,Claudio Luchinat
出处
期刊:Angewandte Chemie [Wiley]
卷期号:58 (4): 968-994 被引量:238
标识
DOI:10.1002/anie.201804736
摘要

Abstract Metabolomics deals with the whole ensemble of metabolites (the metabolome). As one of the ‐omic sciences, it relates to biology, physiology, pathology and medicine; but metabolites are chemical entities, small organic molecules or inorganic ions. Therefore, their proper identification and quantitation in complex biological matrices requires a solid chemical ground. With respect to for example, DNA, metabolites are much more prone to oxidation or enzymatic degradation: we can reconstruct large parts of a mammoth's genome from a small specimen, but we are unable to do the same with its metabolome, which was probably largely degraded a few hours after the animal's death. Thus, we need standard operating procedures, good chemical skills in sample preparation for storage and subsequent analysis, accurate analytical procedures, a broad knowledge of chemometrics and advanced statistical tools, and a good knowledge of at least one of the two metabolomic techniques, MS or NMR. All these skills are traditionally cultivated by chemists. Here we focus on metabolomics from the chemical standpoint and restrict ourselves to NMR. From the analytical point of view, NMR has pros and cons but does provide a peculiar holistic perspective that may speak for its future adoption as a population‐wide health screening technique.
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