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Mitochondrial genome analysis of the predatory mitePhytoseiulus persimilisand a revisit of theMetaseiulus occidentalismitochondrial genome

基因组 生物 线粒体DNA 植蜂科 遗传学 基因 基因组大小 基因密度 基因组进化 植物 捕食 生态学 捕食者
作者
Wannes Dermauw,Bartel Vanholme,Luc Tirry,Thomas Van Leeuwen
出处
期刊:Genome [Canadian Science Publishing]
卷期号:53 (4): 285-301 被引量:33
标识
DOI:10.1139/g10-004
摘要

In this study we sequenced and analysed the complete mitochondrial (mt) genome of the Chilean predatory mite Phytoseiulus persimilis Athias-Henriot (Chelicerata: Acari: Mesostigmata: Phytoseiidae: Amblyseiinae). The 16 199 bp genome (79.8% AT) contains the standard set of 13 protein-coding and 24 RNA genes. Compared with the ancestral arthropod mtDNA pattern, the gene order is extremely reshuffled (35 genes changed position) and represents a novel arrangement within the arthropods. This is probably related to the presence of several large noncoding regions in the genome. In contrast with the mt genome of the closely related species Metaseiulus occidentalis (Phytoseiidae: Typhlodrominae) — which was reported to be unusually large (24 961 bp), to lack nad6 and nad3 protein-coding genes, and to contain 22 tRNAs without T-arms — the genome of P. persimilis has all the features of a standard metazoan mt genome. Consequently, we performed additional experiments on the M. occidentalis mt genome. Our preliminary restriction digests and Southern hybridization data revealed that this genome is smaller than previously reported. In addition, we cloned nad3 in M. occidentalis and positioned this gene between nad4L and 12S-rRNA on the mt genome. Finally, we report that at least 15 of the 22 tRNAs in the M. occidentalis mt genome can be folded into canonical cloverleaf structures similar to their counterparts in P. persimilis.
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