亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation

蛋白质组 计算生物学 蛋白质组学 转录组 单细胞分析 质谱法 细胞周期蛋白 细胞周期 染色质 化学 系统生物学 细胞 稳健性(进化) 生物 细胞生物学 生物信息学 DNA 生物化学 色谱法 基因表达 基因
作者
Andreas-David Brunner,Marvin Thielert,Catherine G. Vasilopoulou,Constantin Ammar,Fabian Coscia,Andreas Mund,Ole Hørning,Nicolai Bache,Amalia Apalategui,Markus Lübeck,Oliver Raether,Melvin Park,Sabrina Richter,David Fischer,Fabian J. Theis,Florian Meier,Matthias Mann
标识
DOI:10.1101/2020.12.22.423933
摘要

Abstract Single-cell technologies are revolutionizing biology but are today mainly limited to imaging and deep sequencing 1–3 . However, proteins are the main drivers of cellular function and in-depth characterization of individual cells by mass spectrometry (MS)-based proteomics would thus be highly valuable and complementary 4,5 . Chemical labeling-based single-cell approaches introduce hundreds of cells into the MS, but direct analysis of single cells has not yet reached the necessary sensitivity, robustness and quantitative accuracy to answer biological questions 6,7 . Here, we develop a robust workflow combining miniaturized sample preparation, very low flow-rate chromatography and a novel trapped ion mobility mass spectrometer, resulting in a more than ten-fold improved sensitivity. We accurately and robustly quantify proteomes and their changes in single, FACS-isolated cells. Arresting cells at defined stages of the cell cycle by drug treatment retrieves expected key regulators such as CDK2NA, the E2 ubiquitin ligase UBE2S, DNA topoisomerases TOP2A/B and the chromatin regulator HMGA1. Furthermore, it highlights potential novel ones and allows cell phase prediction. Comparing the variability in more than 430 single-cell proteomes to transcriptome data revealed a stable core proteome despite perturbation, while the transcriptome appears volatile. This emphasizes substantial regulation of translation and sets the stage for its elucidation at the single cell level. Our technology can readily be applied to ultra-high sensitivity analyses of tissue material 8 , posttranslational modifications and small molecule studies to gain unprecedented insights into cellular heterogeneity in health and disease.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
赘婿应助科研通管家采纳,获得10
刚刚
汉堡包应助科研通管家采纳,获得10
刚刚
2秒前
笨笨善若发布了新的文献求助10
7秒前
Tristan完成签到 ,获得积分10
9秒前
唠叨的傲薇完成签到 ,获得积分10
11秒前
笨笨善若完成签到,获得积分10
13秒前
夏瑞发布了新的文献求助30
16秒前
深情安青应助栗栗栗子采纳,获得10
20秒前
21秒前
21秒前
拾光完成签到,获得积分10
25秒前
哈哈发布了新的文献求助10
28秒前
FrozNineTivus完成签到,获得积分10
28秒前
兜兜完成签到 ,获得积分10
30秒前
哈哈完成签到,获得积分10
54秒前
夏瑞完成签到,获得积分10
57秒前
wangyang完成签到 ,获得积分10
57秒前
闪闪蜜粉完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
lailai完成签到 ,获得积分10
1分钟前
cgg完成签到 ,获得积分10
1分钟前
迷你的靖雁完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
小L完成签到 ,获得积分10
1分钟前
核桃发布了新的文献求助10
1分钟前
斜阳完成签到 ,获得积分10
1分钟前
xiloyou完成签到 ,获得积分10
1分钟前
大个应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
luna完成签到,获得积分10
2分钟前
2分钟前
2分钟前
2分钟前
2分钟前
lsm发布了新的文献求助10
2分钟前
2分钟前
2分钟前
和谐诗双完成签到 ,获得积分10
2分钟前
高分求助中
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
基于可调谐半导体激光吸收光谱技术泄漏气体检测系统的研究 350
Robot-supported joining of reinforcement textiles with one-sided sewing heads 320
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3990012
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3532077
关于积分的说明 11256227
捐赠科研通 3270933
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1805139
邀请新用户注册赠送积分活动 882270
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 809228