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azyx-1 is a new gene that overlaps with zyxin and affects its translation in C. elegans, impacting muscular integrity and locomotion

生物 秀丽隐杆线虫 翻译(生物学) 遗传学 基因 基因亚型 基因表达调控 细胞生物学 计算生物学 信使核糖核酸
作者
Bhavesh S. Parmar,Amanda Kieswetter,Ellen Geens,Elke Vandewyer,Christina Ludwig,Liesbet Temmerman
出处
期刊:PLOS Biology [Public Library of Science]
卷期号:21 (9): e3002300-e3002300
标识
DOI:10.1371/journal.pbio.3002300
摘要

Overlapping genes are widely prevalent; however, their expression and consequences are poorly understood. Here, we describe and functionally characterize a novel zyx-1 overlapping gene, azyx-1 , with distinct regulatory functions in Caenorhabditis elegans . We observed conservation of alternative open reading frames (ORFs) overlapping the 5′ region of zyxin family members in several animal species, and find shared sites of azyx-1 and zyxin proteoform expression in C . elegans . In line with a standard ribosome scanning model, our results support cis regulation of zyx-1 long isoform(s) by upstream initiating azyx-1a . Moreover, we report on a rare observation of trans regulation of zyx-1 by azyx-1 , with evidence of increased ZYX-1 upon azyx-1 overexpression. Our results suggest a dual role for azyx-1 in influencing zyx-1 proteoform heterogeneity and highlight its impact on C . elegans muscular integrity and locomotion.
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