Molecular Tools for Candida auris Identification and Typing

金念珠菌 基因分型 打字 鉴定(生物学) 微卫星 生物 计算生物学 遗传学 基因型 等位基因 基因 微生物学 抗真菌 植物
作者
Auke W. de Jong,Bert Gerrits van den Ende,Ferry Hagen
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 33-41 被引量:2
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-2417-3_3
摘要

Identification of Candida auris by conventional identification methodologies can be challenging. While whole genome sequencing is seen as the golden standard to genotype C. auris at an inter- and intraspecies level, it is costly and time-consuming. Sequencing the transcribed spacer (ITS) region and microsatellite typing provide simple, fast, and inexpensive alternatives for identification and genotyping of C. auris. Here we will describe both molecular approaches.
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