Methodology Development in Directed Evolution: Exploring Options when Applying Triple‐Code Saturation Mutagenesis

饱和突变 定向进化 区域选择性 突变 化学 立体选择性 组合化学 立体化学 计算生物学 突变体 生物化学 生物 基因 催化作用 有机化学
作者
Ge Qu,Richard Lonsdale,Peiyuan Yao,Guangyue Li,Beibei Liu,Manfred T. Reetz,Zhoutong Sun
出处
期刊:ChemBioChem [Wiley]
卷期号:19 (3): 239-246 被引量:23
标识
DOI:10.1002/cbic.201700562
摘要

Directed evolution of stereo- or regioselective enzymes as catalysts in asymmetric transformations is of particular interest in organic synthesis. Upon evolving these biocatalysts, screening is the bottleneck. To beat the numbers problem most effectively, methods and strategies for building "small but smart" mutant libraries have been developed. Herein, we compared two different strategies regarding the application of triple-code saturation mutagenesis (TCSM) at multiresidue sites of the Thermoanaerobacter brockii alcohol dehydrogenase by using distinct reduced amino-acid alphabets. By using the synthetically difficult-to-reduce prochiral ketone tetrahydrofuran-3-one as a substrate, highly R- and S-selective variants were obtained (92-99 % ee) with minimal screening. The origin of stereoselectivity was provided by molecular dynamics analyses, which is discussed in terms of the Bürgi-Dunitz trajectory.
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