Proteogenomics of Non-smoking Lung Cancer in East Asia Delineates Molecular Signatures of Pathogenesis and Progression

生物 蛋白质基因组学 阿波贝克 肺癌 疾病 腺癌 蛋白质组学 癌症研究 癌症 基因 遗传学 肿瘤科 生物信息学 基因组学 病理 基因组 医学
作者
Yi Ju Chen,Theodoros I. Roumeliotis,Yun‐chien Chang,Ching Tai Chen,Chia Li Han,Miao Lin,Huei‐Wen Chen,Gee Chen Chang,Yih‐Leong Chang,Chen Wu,Mong-Wei Lin,Min Shu Hsieh,Yu Tai Wang,Yet Ran Chen,Inge Jonassen,Fatemeh Zamanzad Ghavidel,Ze Shiang Lin,Kuen Tyng Lin,Ching Wen Chen,Pei Yuan Sheu,Chi‐Ren Hung,Ke Huang,Hao Yang,Pei Lin,Ta Chi Yen,Yi Lin,Jen Hung Wang,Lovely Raghav,Chien Yu Lin,Yan Si Chen,Pei‐Ju Wu,Chi Ting Lai,Shao Hsing Weng,Kang-Yi Su,Wei Hung Chang,Pang-Yen Tsai,Ana I. Robles,Henry Rodriguez,Yi-Jing Hsiao,Wen Hsin Chang,Ting Yi Sung,Jin‐Shing Chen,Sung-Liang Yu,Jyoti S. Choudhary,Hsuan Yu Chen,Pan Chyr Yang,Yu‐Ju Chen
出处
期刊:Cell [Elsevier]
卷期号:182 (1): 226-244.e17 被引量:179
标识
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.012
摘要

Lung cancer in East Asia is characterized by a high percentage of never-smokers, early onset and predominant EGFR mutations. To illuminate the molecular phenotype of this demographically distinct disease, we performed a deep comprehensive proteogenomic study on a prospectively collected cohort in Taiwan, representing early stage, predominantly female, non-smoking lung adenocarcinoma. Integrated genomic, proteomic, and phosphoproteomic analysis delineated the demographically distinct molecular attributes and hallmarks of tumor progression. Mutational signature analysis revealed age- and gender-related mutagenesis mechanisms, characterized by high prevalence of APOBEC mutational signature in younger females and over-representation of environmental carcinogen-like mutational signatures in older females. A proteomics-informed classification distinguished the clinical characteristics of early stage patients with EGFR mutations. Furthermore, integrated protein network analysis revealed the cellular remodeling underpinning clinical trajectories and nominated candidate biomarkers for patient stratification and therapeutic intervention. This multi-omic molecular architecture may help develop strategies for management of early stage never-smoker lung adenocarcinoma.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
36456657应助卤蛋红采纳,获得10
刚刚
沙河口大长硬完成签到,获得积分10
刚刚
刚刚
Ava应助巴巴爸爸采纳,获得10
1秒前
ZPP发布了新的文献求助10
1秒前
学霸业完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
3秒前
这不得行发布了新的文献求助10
3秒前
沐雨发布了新的文献求助10
3秒前
4秒前
彭于晏应助donny采纳,获得10
5秒前
叶sir发布了新的文献求助10
5秒前
7秒前
充电宝应助淡定小蜜蜂采纳,获得10
7秒前
贺小刚发布了新的文献求助10
8秒前
hele发布了新的文献求助10
9秒前
老实的棉花糖完成签到,获得积分10
12秒前
欣喜成仁完成签到 ,获得积分10
12秒前
灯泡泡完成签到,获得积分10
13秒前
互助遵法尚德应助Godspeed采纳,获得10
13秒前
14秒前
14秒前
15秒前
希望天下0贩的0应助IAMXC采纳,获得10
15秒前
15秒前
tonghau895完成签到 ,获得积分10
17秒前
18秒前
科研通AI2S应助一只东北鸟采纳,获得10
18秒前
zhao完成签到,获得积分20
19秒前
星辰大海应助橙c美式采纳,获得10
19秒前
19秒前
19秒前
WTX发布了新的文献求助10
20秒前
叶sir完成签到,获得积分20
21秒前
22秒前
Leo完成签到,获得积分10
22秒前
23秒前
25秒前
qin希望应助ZPP采纳,获得10
25秒前
高分求助中
Sustainability in Tides Chemistry 2800
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
Foreign Policy of the French Second Empire: A Bibliography 500
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
XAFS for Everyone 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3143779
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2795335
关于积分的说明 7814327
捐赠科研通 2451315
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1304413
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 627221
版权声明 601419