Artificial Intelligence-Assisted Optimization of Antipigmentation Tyrosinase Inhibitors: De Novo Molecular Generation Based on a Low Activity Lead Compound

化学 酪氨酸酶 模板 药物发现 曲酸 计算生物学 组合化学 铅化合物 生物化学 纳米技术 体外 生物 材料科学
作者
Hong Cai,Wenchao Chen,Jing Jiang,Hao Wen,Xinyu Luo,Junjie Li,Liuxin Lu,Rui Zhao,Xinhua Ni,Yinyan Sun,Jiahui Wang,Zhen Li,Bin Ju,Xiaoying Jiang,Renren Bai
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:67 (9): 7260-7275
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.4c00091
摘要

Artificial intelligence (AI) de novo molecular generation is a highly promising strategy in the drug discovery, with deep reinforcement learning (RL) models emerging as powerful tools. This study introduces a fragment-by-fragment growth RL forward molecular generation and optimization strategy based on a low activity lead compound. This process integrates fragment growth-based reaction templates, while target docking and drug-likeness prediction were simultaneously performed. This comprehensive approach considers molecular similarity, internal diversity, synthesizability, and effectiveness, thereby enhancing the quality and efficiency of molecular generation. Finally, a series of tyrosinase inhibitors were generated and synthesized. Most compounds exhibited more improved activity than lead, with an optimal candidate compound surpassing the effects of kojic acid and demonstrating significant antipigmentation activity in a zebrafish model. Furthermore, metabolic stability studies indicated susceptibility to hepatic metabolism. The proposed AI structural optimization strategies will play a promising role in accelerating the drug discovery and improving traditional efficiency.
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