Liquid condensate is a common state of proteins and polypeptides at the regime of high intermolecular interactions

分子间力 化学 聚乙二醇 核酸 生物物理学 高分子 内在无序蛋白质 生物分子 化学物理 细胞器 相(物质) PEG比率 生物化学 分子 生物 有机化学 经济 财务
作者
Manisha Poudyal,Komal Patel,Ajay Singh Sawner,Laxmikant Gadhe,Pradeep Kadu,Debalina Datta,Semanti Mukherjee,Soumik Ray,Ambuja Navalkar,S.K. Maiti,Debdeep Chatterjee,Riya Bera,Nitisha Gahlot,Samir K. Maji,Samir K. Maji
标识
DOI:10.1101/2021.12.31.474648
摘要

Abstract Liquid-liquid phase separation (LLPS) has emerged as a crucial biological mechanism for sequestering macromolecules (such as proteins and nucleic acids) into membraneless organelles in cells. Unstructured and intrinsically disordered domains are known to facilitate multivalent interactions driving protein LLPS. We hypothesized that LLPS could be an intrinsic property of proteins/polypeptides at their high intermolecular interaction regime. To examine this, we studied many (a total of 23) proteins/polypeptides with different structures and sequences for LLPS study using molecular crowder polyethylene glycol (PEG-8000). We showed that all proteins and even highly charged polypeptides (under study) can undergo liquid condensate formation, however with different phase space and conditions. Using a single component and combinations of protein multicomponent (co-LLPS) systems, we establish that a variety of intermolecular interactions can drive proteins/polypeptides LLPS.

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