Understanding and Engineering Glycine Cleavage System and Related Metabolic Pathways for C1-Based Biosynthesis

代谢工程 格式化 代谢途径 背景(考古学) DNA连接酶 生物合成 合成生物学 生物化学 生化工程 计算生物学 蛋白质工程 化学 计算机科学 生物 工程类 古生物学 催化作用
作者
Jie Ren,Wei Wang,Jinglei Nie,Wenqiao Yuan,An‐Ping Zeng
出处
期刊:Advances in Biochemical Engineering / Biotechnology [Springer Science+Business Media]
卷期号:180: 273-298 被引量:12
标识
DOI:10.1007/10_2021_186
摘要

The glycine cleavage system (GCS) is a fundamental component of life, widely existing in microbes, plants, animals, and humans. A better understanding of the functionality and working mechanisms, and the engineering of the GCS have both scientific and practical impacts, which may lead to new knowledge and findings in life sciences, improved biomass production and human/animal health, efficient biosynthesis of chemicals, effective carbon fixation and global climate change mitigation. In this chapter, the GCS is first discussed in the context of the reductive glycine pathway (rGlyP), a recently proposed and appealing assimilation pathway of CO2 and formate, and its implementation and optimization in microorganisms for formatotrophic growth. Then, the present knowledge about the components, reactions, and working mechanisms of the GCS and related enzymes is reviewed. Particular emphasis is also placed on the conformational and structural features of the GCS proteins, especially the different forms of lipoylated H protein and its lipoylation by lipoate protein ligase (LplA). Subsequently, existing analytic methods for the components and reactions of the GCS and recent advances in quantitatively understanding and purposefully engineering the GCS are presented. Finally, perspectives of current state of the art in the GCS research are given and future research needs are highlighted.
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