In Silico Models for Developmental Toxicity

计算机科学 生物信息学 领域(数学分析) 基础(线性代数) 统计模型 机器学习 数据挖掘 人工智能 生物 数学 数学分析 生物化学 几何学 基因
作者
Marco Marzo,Alessandra Roncaglioni,Sunil Kulkarni,Tara S. Barton‐Maclaren,Emilio Benfenati
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 217-240 被引量:6
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-1960-5_10
摘要

Modeling developmental toxicity has been a challenge for (Q)SAR model developers due to the complexity of the endpoint. Recently, some new in silico methods have been developed introducing the possibility to evaluate the integration of existing methods by taking advantage of various modeling perspectives. It is important that the model user is aware of the underlying basis of the different models in general, as well as the considerations and assumptions relative to the specific predictions that are obtained from these different models for the same chemical. The evaluation on the predictions needs to be done on a case-by-case basis, checking the analogues (possibly using structural, physicochemical, and toxicological information); for this purpose, the assessment of the applicability domain of the models provides further confidence in the model prediction. In this chapter, we present some examples illustrating an approach to combine human-based rules and statistical methods to support the prediction of developmental toxicity; we also discuss assumptions and uncertainties of the methodology.
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