Development of SARS-CoV-2 packaged RNA reference material for nucleic acid testing

核酸 核糖核酸 严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2) 化学 计算生物学 2019年冠状病毒病(COVID-19) 生化工程 生物 工程类 生物化学 医学 基因 病理 传染病(医学专业) 疾病
作者
Sang‐Soo Lee,Seil Kim,Hee Min Yoo,Da-Hye Lee,Young‐Kyung Bae
出处
期刊:Analytical and Bioanalytical Chemistry [Springer Nature]
卷期号:414 (5): 1773-1785 被引量:13
标识
DOI:10.1007/s00216-021-03846-y
摘要

Nucleic acid tests to detect the SARS-CoV-2 virus have been performed worldwide since the beginning of the COVID-19 pandemic. For the quality assessment of testing laboratories and the performance evaluation of molecular diagnosis products, reference materials (RMs) are required. In this work, we report the production of a lentiviral SARS-CoV-2 RM containing approximately 12 kilobases of its genome including common diagnostics targets such as RdRp, N, E, and S genes. The RM was measured with multiple assays using two different digital PCR platforms. To measure the homogeneity and stability of the lentiviral SARS-CoV-2 RM, reverse transcription droplet digital PCR (RT-ddPCR) was used with in-house duplex assays. The copy number concentration of each target gene in the extracted RNA solution was then converted to that of the RM solution. Their copy number values are measured to be from 1.5 × 10
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