The Immune Epitope Database (IEDB): 2024 update

标准化 生物 互操作性 资源(消歧) 表位 数据科学 计算生物学 数据库 生物技术 计算机科学 万维网 遗传学 计算机网络 抗原 操作系统
作者
Randi Vita,Nina Blazeska,Daniel Marrama,Deborah A. Shackelford,L S Zalman,Gabriele Foos,Laura Zarebski,Kenneth Chun‐Ho Chan,Brian Reardon,Sandra Fitzpatrick,Matthew Busse,Sara L. Coleman,Caitlin Sedwick,Lindy Edwards,Catriona Macfarlane,Marcus Ennis,Sebastian Duesing,Jason W. Bennett,Jason Greenbaum,Marcus Fabiano de Almeida Mendes
出处
期刊:Nucleic Acids Research [Oxford University Press]
卷期号:53 (D1): D436-D443 被引量:1
标识
DOI:10.1093/nar/gkae1092
摘要

Abstract Over the past 20 years, the Immune Epitope Database (IEDB, iedb.org) has established itself as the foremost resource for immune epitope data. The IEDB catalogs published epitopes and their contextual experimental data in a freely searchable public resource. The IEDB team manually curates data from the literature into a structured format and spans infectious, allergic, autoimmune, and transplant diseases. Here, we describe the enhancements made since our 2018 paper, capturing user-directed updates to the search interface, advanced data exports, increases in data quality, and improved interoperability across related resources. As we look forward to the next 20 years, we are confident in our ability to meet the needs of our users and to contribute to the broader field of data standardization.
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