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The yak genome and adaptation to life at high altitude

生物 基因组 适应(眼睛) 基因 高海拔对人类的影响 遗传学 缺氧(环境) 谱系(遗传) 进化生物学 牦牛 高度(三角形) 计算生物学 动物科学 解剖 数学 神经科学 有机化学 化学 氧气 几何学
作者
Qiang Qiu,Guojie Zhang,Tao Ma,Wubin Qian,Junyi Wang,Zhiqiang Ye,C Cao,Quanjun Hu,Jaebum Kim,Denis M. Larkin,Loretta Auvil,Boris Capitanu,Jian Ma,Harris A. Lewin,Xiaoju Qian,Yongshan Lang,Ran Zhou,Lizhong Wang,Kun Wang,Jinquan Xia,Sheng-Guang Liao,Shengkai Pan,Xu Lu,Haolong Hou,Yan Wang,Xuetao Zang,Ye Yin,Hui Ma,Jian Zhang,Zhaofeng Wang,Yingmei Zhang,Dawei Zhang,Takahiro Yonezawa,Masami Hasegawa,Yang Zhong,Wenbin Liu,Yan Zhang,Zhiyong Huang,Shengxiang Zhang,Ruijun Long,Huanming Yang,Jian Wang,Johannes A. Lenstra,D.N. Cooper,Yi Wu,Jun Wang,Peng Shi,Jian Wang,Jianquan Liu
出处
期刊:Nature Genetics [Springer Nature]
卷期号:44 (8): 946-949 被引量:753
标识
DOI:10.1038/ng.2343
摘要

Domestic yaks (Bos grunniens) provide meat and other necessities for Tibetans living at high altitude on the Qinghai-Tibetan Plateau and in adjacent regions. Comparison between yak and the closely related low-altitude cattle (Bos taurus) is informative in studying animal adaptation to high altitude. Here, we present the draft genome sequence of a female domestic yak generated using Illumina-based technology at 65-fold coverage. Genomic comparisons between yak and cattle identify an expansion in yak of gene families related to sensory perception and energy metabolism, as well as an enrichment of protein domains involved in sensing the extracellular environment and hypoxic stress. Positively selected and rapidly evolving genes in the yak lineage are also found to be significantly enriched in functional categories and pathways related to hypoxia and nutrition metabolism. These findings may have important implications for understanding adaptation to high altitude in other animal species and for hypoxia-related diseases in humans.
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