Terriglobus tenax sp. nov., an exopolysaccharide-producing acidobacterium isolated from rhizosphere soil of a medicinal plant

生物 16S核糖体RNA 根际 拉伤 植物 系统发育树 微生物学 基因组DNA 氧化酶试验 细菌 基因 生物化学 遗传学 解剖
作者
Kyung-Sook Whang,Jae-Chan Lee,Hae-Ran Lee,Song-Ih Han,Sang‐Ho Chung
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:64 (Pt_2): 431-437 被引量:32
标识
DOI:10.1099/ijs.0.053769-0
摘要

An exopolysaccharide-producing bacterium, designated strain DRP 35 T , was isolated from the rhizosphere soil of a medicinal herb, Angelica sinensis, at Geumsan in Korea. Cells were Gram-staining-negative, non-motile, catalase-positive and oxidase-negative short rods. The isolate grew aerobically from 15 to 45 °C (optimum 30 °C), pH 3.5–7.0 (optimum pH 5.0) and in the presence of 0–1.0 % (w/v) NaCl. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences indicated that strain DRP 35 T belongs to the genus Terriglobus in the phylum Acidobacteria with a sequence similarity of 97.2 % and 97.0 % to Terriglobus saanensis SP1PR4 T and Terriglobus roseus KBS63 T , respectively. The genomic DNA G+C content was 62.1 mol%. DNA–DNA relatedness between strain DRP 35 T and the type strains of the other species of the genus Terriglobus , T. saanensis SP1PR4 T and T. roseus KBS63 T , were 24.6 and 17.2 %, respectively. The predominant menaquinone was MK-8. Major fatty acids were iso-C 15 : 0 , C 16 : 1 ω7 c and C 16 : 0 . The polar lipids were phosphatidylethanolamine, unidentified aminophospholipid and unknown phospholipids. On the basis of polyphasic analysis from this study, strain DRP 35 T represents a novel species of the genus Terriglobus for which the name Terriglobus tenax sp. nov. is proposed. The type strain is DRP 35 T ( = KACC 16474 T = NBRC 109677 T ).
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