Identification of a Risk Signature and Immune Cell Infiltration Based on Extracellular Matrix-Related lncRNAs in Lung Adenocarcinoma

比例危险模型 列线图 肿瘤科 腺癌 生存分析 医学 肺癌 单变量 内科学 癌症 多元统计 计算机科学 机器学习
作者
Moyuan Zhang,Tianqi Cen,Shaohui Huang,Jing Wang,Xuan Wu,Xingru Zhao,Xu Zhiwei,Xiaoju Zhang
出处
期刊:Critical Reviews in Eukaryotic Gene Expression [Begell House Inc.]
卷期号:35 (1): 49-65
标识
DOI:10.1615/critreveukaryotgeneexpr.v34.i1.50
摘要

Lung adenocarcinoma (LUAD) is the leading cause of cancer-related deaths globally, with late diagnoses often resulting in poor prognoses. The extracellular matrix (ECM) plays a crucial role in cancer cell processes. Using big data from RNA-seq of LUAD, we aimed to screen ECM-related lncRNAs (long noncoding RNAs) to determine their prognostic significance. Our study analyzed the LUAD cohort from The Cancer Genome Atlas (TCGA). Univariate Cox analysis identified prognostic lncRNAs, and least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression analysis, followed by multivariate Cox analysis, was used to construct a prognostic model. Kaplan-Meier and ROC curves evaluated the model's prognostic performance. A nomogram was created to predict 3-year survival. Enrichment analysis identified biological processes and pathways involved in the signature. Correlations with the tumor microenvironment (TME) and tumor mutation burden (TMB) were analyzed, and potential drug sensitivities for LUAD were predicted. We initially identified 218 ECM-associated genes and 427 ECM-associated lncRNAs within the TCGA LUAD cohort. Subsequent univariate Cox regression analysis selected 26 lncRNAs with significant prognostic value, and an overall survival (OS)-based LASSO Cox regression model further narrowed this to 14 lncRNAs. Multiple Cox regression analyses then distilled these down to 8 critical lncRNAs forming our prognostic risk signature. Nomograms accurately predicted survival. Finally, several potential therapeutic drugs, including afatinib and crizotinib, were identified. Big data analysis established a prognostic signature that predicts survival and immunization in LUAD patients, providing new insights into survival and treatment options.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
董老师完成签到 ,获得积分10
1秒前
123发布了新的文献求助10
3秒前
Rainlistener完成签到,获得积分10
4秒前
5秒前
8秒前
詹姆斯哈登完成签到,获得积分10
8秒前
DianaLee完成签到 ,获得积分10
11秒前
12秒前
12秒前
成为一只会科研的猫完成签到 ,获得积分10
13秒前
火星的雪完成签到 ,获得积分0
14秒前
fufufu123完成签到 ,获得积分10
14秒前
科研通AI6应助Davidjin采纳,获得10
15秒前
陈麦关注了科研通微信公众号
16秒前
淡然冬灵完成签到,获得积分10
16秒前
科研助理发布了新的文献求助10
17秒前
tangli完成签到 ,获得积分10
19秒前
CipherSage应助宜菏采纳,获得10
21秒前
jason完成签到 ,获得积分10
21秒前
恋恋青葡萄完成签到,获得积分10
22秒前
25秒前
ho完成签到,获得积分10
28秒前
LingYun完成签到,获得积分10
30秒前
yznfly应助ho采纳,获得200
33秒前
栖梧砚客完成签到 ,获得积分10
34秒前
刘歌完成签到 ,获得积分10
34秒前
Mercury完成签到 ,获得积分10
35秒前
贾方硕完成签到,获得积分10
35秒前
888完成签到,获得积分10
39秒前
Lincoln完成签到,获得积分10
40秒前
HCLonely完成签到,获得积分0
43秒前
科研通AI2S应助Muncy采纳,获得20
47秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
49秒前
独特的秋完成签到 ,获得积分10
49秒前
吉吉国王完成签到 ,获得积分10
50秒前
52秒前
13633501455完成签到 ,获得积分10
53秒前
哎呀哎呀呀完成签到,获得积分10
54秒前
科研助理发布了新的文献求助10
55秒前
你好纠结伦完成签到,获得积分10
55秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Encyclopedia of Agriculture and Food Systems Third Edition 2000
Clinical Microbiology Procedures Handbook, Multi-Volume, 5th Edition 临床微生物学程序手册,多卷,第5版 2000
人脑智能与人工智能 1000
King Tyrant 720
Silicon in Organic, Organometallic, and Polymer Chemistry 500
Principles of Plasma Discharges and Materials Processing, 3rd Edition 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 计算机科学 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 复合材料 内科学 化学工程 人工智能 催化作用 遗传学 数学 基因 量子力学 物理化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5599922
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4685747
关于积分的说明 14838974
捐赠科研通 4674097
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2538431
邀请新用户注册赠送积分活动 1505597
关于科研通互助平台的介绍 1471086