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Duganella dendranthematis sp. nov. and Massilia forsythiae sp. nov., isolated from flowers

生物 16S核糖体RNA 拉伤 磷脂酰甘油 系统发育树 微生物学 多位点序列分型 植物 细菌 基因 基因型 遗传学 磷脂 磷脂酰胆碱 解剖
作者
Jun Heo,Mi-Young Won,Daseul Lee,Byeong-Hak Han,Seung-Beom Hong,Soon-Wo Kwon
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:72 (8)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005487
摘要

Two aerobic, Gram-stain-negative, motile, mesophilic, rod-shaped and catalase-positive bacterial strains designated AF9R3T and GN2-R2T were isolated from flowers collected in the Republic of Korea. Strain AF9R3T grew at 4-33 °C, pH 4.0-9.0 and with 0-1 % NaCl (w/v), and strain GN2-R2T grew at 10-33 °C, pH 4.0-9.0 and with 0-1 % NaCl (w/v). Phylogenetic analysis on the basis of 16S rRNA gene sequences indicated that strains AF9R3T and GN2-R2T belonged to the genera Duganella and Massilia, respectively, showing high sequence similarity to Duganella levis CY42WT (99.4 %) and Massilia putida 6 NM-7T (98.0 %), respectively. Both strains contained summed feature 3 (C16 : 1 ω7c and/or C16 : 1 ω6c) and C16 : 0 as the major fatty acids, and ubiquinone Q-8 as the predominant quinone. Strain AF9R3T had diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol and phosphatidylethanolamine, and strain GN2-R2T comprised diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine and an unidentified phospholipid as the major polar lipids. Orthologous average nucleotide identity and digital DNA-DNA hybridization values of strain AF9R3T to its closest relative D. levis CY42WT were 92.6 and 56.5 %, and those of strain GN2-R2T to its closest relative M. putida 6 NM-7T were 81.4 and 24.8 %. Based on genotypic and phenotypic data, strains AF9R3T and GN2-R2T are considered to represent novel species of the genus Duganella and Massilia, respectively, for which the names Duganella dendranthematis sp. nov. (type strain AF9R3T=KACC 21258T=NBRC 114510T) and Massilia forsythiae sp. nov. (type strain GN2-R2T=KACC 21261T=NBRC 114511T) have been proposed.
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