Genomic transcription factor binding site selection is edited by the chromatin remodeling factor CHD4

生物 染色质 增强子 先锋因素 转录因子 染色质重塑 嘉雅宠物 重编程 细胞生物学 福克斯A1 增强子rna 二价染色质 核小体 一般转录因子 遗传学 发起人 基因表达 基因
作者
Mika Saotome,Deepak Poduval,Sara A. Grimm,Aerica Nagornyuk,S. D. Gunarathna,Takashi Shimbo,Paul A. Wade,Motoki Takaku
出处
期刊:Nucleic Acids Research [Oxford University Press]
被引量:1
标识
DOI:10.1093/nar/gkae025
摘要

Abstract Biologically precise enhancer licensing by lineage-determining transcription factors enables activation of transcripts appropriate to biological demand and prevents deleterious gene activation. This essential process is challenged by the millions of matches to most transcription factor binding motifs present in many eukaryotic genomes, leading to questions about how transcription factors achieve the exquisite specificity required. The importance of chromatin remodeling factors to enhancer activation is highlighted by their frequent mutation in developmental disorders and in cancer. Here, we determine the roles of CHD4 in enhancer licensing and maintenance in breast cancer cells and during cellular reprogramming. In unchallenged basal breast cancer cells, CHD4 modulates chromatin accessibility. Its depletion leads to redistribution of transcription factors to previously unoccupied sites. During cellular reprogramming induced by the pioneer factor GATA3, CHD4 activity is necessary to prevent inappropriate chromatin opening. Mechanistically, CHD4 promotes nucleosome positioning over GATA3 binding motifs to compete with transcription factor–DNA interaction. We propose that CHD4 acts as a chromatin proof-reading enzyme that prevents unnecessary gene expression by editing chromatin binding activities of transcription factors.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
阿姨洗铁路完成签到 ,获得积分10
1秒前
抹不掉的记忆完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
余杭村王小虎完成签到,获得积分10
4秒前
韭黄完成签到,获得积分20
8秒前
jeffrey完成签到,获得积分10
8秒前
Rondab应助机灵枕头采纳,获得10
14秒前
佳无夜完成签到,获得积分10
19秒前
摆哥完成签到,获得积分10
23秒前
66完成签到,获得积分10
28秒前
zlqq完成签到 ,获得积分10
28秒前
Hardskills发布了新的文献求助10
31秒前
32秒前
之_ZH完成签到 ,获得积分10
40秒前
gds2021完成签到 ,获得积分10
42秒前
你好呀嘻嘻完成签到 ,获得积分10
42秒前
梅特卡夫完成签到,获得积分10
44秒前
熊雅完成签到,获得积分10
45秒前
47秒前
睡到自然醒完成签到 ,获得积分10
48秒前
cis2014完成签到,获得积分10
50秒前
独特的大有完成签到 ,获得积分10
50秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
51秒前
53秒前
xingyi完成签到,获得积分10
55秒前
56秒前
舒心的秋荷完成签到 ,获得积分10
59秒前
zz123发布了新的文献求助10
1分钟前
liaomr完成签到 ,获得积分10
1分钟前
粗犷的灵松完成签到,获得积分10
1分钟前
吃小孩的妖怪完成签到 ,获得积分10
1分钟前
ncuwzq完成签到,获得积分10
1分钟前
yshj完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
净禅完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
迷人的寒风完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
water应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
Lucas应助HHHAN采纳,获得10
1分钟前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038112
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575788
关于积分的说明 11373801
捐赠科研通 3305604
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819255
邀请新用户注册赠送积分活动 892655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022