亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Targeted and Logical Discovery of Piperazic Acid-Bearing Natural Products Based on Genomic and Spectroscopic Signatures

化学 方位(导航) 自然(考古学) 药物发现 组合化学 生物化学 计算生物学 生物 人工智能 考古 计算机科学 历史
作者
Daniel Shin,Woong Sub Byun,Sangwook Kang,Ilnam Kang,Eun Seo Bae,Joon Soo An,Ji Hyeon Im,Jiyoon Park,Eunji Kim,Keebeom Ko,Sunghoon Hwang,Honghui Lee,Y.S. Kwon,Yoon‐Joo Ko,Suckchang Hong,Sang‐Jip Nam,Seung Bum Kim,William Fenical,Yeo Joon Yoon,Jang‐Cheon Cho,Sang Kook Lee,Dong‐Chan Oh
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
卷期号:145 (36): 19676-19690 被引量:5
标识
DOI:10.1021/jacs.3c04699
摘要

A targeted and logical discovery method was devised for natural products containing piperazic acid (Piz), which is biosynthesized from ornithine by l-ornithine N-hydroxylase (KtzI) and N-N bond formation enzyme (KtzT). Genomic signature-based screening of a bacterial DNA library (2020 strains) using polymerase chain reaction (PCR) primers targeting ktzT identified 62 strains (3.1%). The PCR amplicons of KtzT-encoding genes were phylogenetically analyzed to classify the 23 clades into two monophyletic groups, I and II. Cultivating hit strains in media supplemented with 15NH4Cl and applying 1H-15N heteronuclear multiple bond correlation (HMBC) along with 1H-15N heteronuclear single quantum coherence (HSQC) and 1H-15N HSQC-total correlation spectroscopy (HSQC-TOCSY) NMR experiments detected the spectroscopic signatures of Piz and modified Piz. Chemical investigation of the hit strains prioritized by genomic and spectroscopic signatures led to the identification of a new azinothricin congener, polyoxyperuin B seco acid (1), previously reported chloptosin (2) in group I, depsidomycin D (3) incorporating two dehydropiperazic acids (Dpz), and lenziamides A and B (4 and 5), structurally novel 31-membered cyclic decapeptides in group II. By consolidating the phylogenetic and chemical analyses, clade-structure relationships were elucidated for 19 of the 23 clades. Lenziamide A (4) inhibited STAT3 activation and induced G2/M cell cycle arrest, apoptotic cell death, and tumor growth suppression in human colorectal cancer cells. Moreover, lenziamide A (4) resensitized 5-fluorouracil (5-FU) activity in both in vitro cell cultures and the in vivo 5-FU-resistant tumor xenograft mouse model. This work demonstrates that the genomic and spectroscopic signature-based searches provide an efficient and general strategy for new bioactive natural products containing specific structural motifs.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
姚老表完成签到,获得积分10
2秒前
6秒前
香蕉觅云应助端庄的饼干采纳,获得10
13秒前
端庄的饼干完成签到,获得积分20
21秒前
科研通AI2S应助spark810采纳,获得10
2分钟前
4分钟前
5分钟前
凭风听纸鸢完成签到,获得积分10
6分钟前
mengliu完成签到,获得积分10
6分钟前
kuoping完成签到,获得积分10
6分钟前
无花果应助科研通管家采纳,获得10
7分钟前
ling361完成签到,获得积分10
7分钟前
早晚完成签到 ,获得积分10
7分钟前
Mipe完成签到,获得积分10
7分钟前
Demi_Ming完成签到,获得积分10
7分钟前
8分钟前
8分钟前
科研通AI2S应助希勤采纳,获得30
8分钟前
材料虎完成签到,获得积分10
8分钟前
慕青应助材料虎采纳,获得10
9分钟前
9分钟前
材料虎发布了新的文献求助10
9分钟前
xwx发布了新的文献求助10
9分钟前
宽宽完成签到,获得积分10
9分钟前
权灵萱完成签到,获得积分10
9分钟前
天边的云彩完成签到 ,获得积分10
10分钟前
一剑白发布了新的文献求助10
10分钟前
10分钟前
10分钟前
10分钟前
852应助科研通管家采纳,获得10
11分钟前
11分钟前
11分钟前
昼夜发布了新的文献求助10
11分钟前
星辰大海应助lensray采纳,获得10
11分钟前
13分钟前
13分钟前
辛勤的天蓝完成签到,获得积分10
13分钟前
13分钟前
高分求助中
Sustainability in Tides Chemistry 2800
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
Rechtsphilosophie 1000
Bayesian Models of Cognition:Reverse Engineering the Mind 888
Le dégorgement réflexe des Acridiens 800
Defense against predation 800
XAFS for Everyone (2nd Edition) 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3133970
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2784836
关于积分的说明 7768684
捐赠科研通 2440205
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1297295
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 624911
版权声明 600791