Improved identification of Streptococcus bovis-Streptococcus equinus-complex species and subspecies by MALDI-TOF MS using a novel library

亚种 牛链球菌 鉴定(生物学) 微生物学 链球菌 物种鉴定 链球菌科 生物 医学 细菌 动物 遗传学 植物 食品科学 抗生素 瘤胃 发酵
作者
Jonas Öberg,Malin Inghammar,Bo Nilson
出处
期刊:Diagnostic Microbiology and Infectious Disease [Elsevier]
卷期号:107 (3): 116045-116045 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2023.116045
摘要

To develop an in-house matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) library for improved identification of species and subspecies of the Streptococcus bovis/Streptococcus equinus-complex (SBSEC). 236 SBSEC isolates from blood stream infections and culture collections, determined by whole genome sequencing to subspecies level, were grown in brain heart infusion broth. Mass spectra were collected using the Bruker MALDI Biotyper system after ethanol-formic acid extraction. Main spectral profiles from 117 isolates were used to create the "SBSEC-CMRS library". The remaining 119 spectra were used for evaluation of Bruker MBT Compass Library Revision K (2022) and the SBSEC-CMRS library. The Bruker library correctly identified species and subspecies in 72/119 (61 %) isolates, while the SBSEC-CMRS library identified 116/119 (97 %), using a cutoff score of ≥2.0. The SBSEC-CMRS library showed sufficient diagnostic accuracy, and can be implemented in clinical practice for SBSEC species and subspecies identification.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
希望天下0贩的0应助迟归采纳,获得10
刚刚
背侧丘脑发布了新的文献求助20
3秒前
aizhujun发布了新的文献求助10
4秒前
葭月十七发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
5秒前
酷波er应助joy采纳,获得10
6秒前
7秒前
7秒前
爱撒娇的子默完成签到,获得积分10
8秒前
木安完成签到,获得积分10
8秒前
9秒前
丘比特应助mxq采纳,获得10
9秒前
10秒前
wzh发布了新的文献求助10
11秒前
11秒前
超超发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
小蘑菇应助弄香采纳,获得10
12秒前
wheattt完成签到,获得积分10
12秒前
科研通AI2S应助小巧问柳采纳,获得10
13秒前
14秒前
DXiao完成签到,获得积分10
14秒前
ferrycake应助aizhujun采纳,获得20
14秒前
15秒前
cc完成签到 ,获得积分10
15秒前
黑冰台的白甲士完成签到,获得积分10
15秒前
16秒前
css1997发布了新的文献求助10
17秒前
19秒前
20秒前
思源应助MLi采纳,获得10
20秒前
小马甲应助周周采纳,获得10
22秒前
刘文涛发布了新的文献求助10
23秒前
23秒前
情怀应助邹鹏采纳,获得10
23秒前
24秒前
明亮白筠完成签到,获得积分10
24秒前
25秒前
lxz3131发布了新的文献求助10
25秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Mixed-anion Compounds 600
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
Earth System Geophysics 500
Aspects of Babylonian celestial divination: the lunar eclipse tablets of Enūma Anu Enlil 500
Geochemistry, 2nd Edition 地球化学经典教科书第二版 401
2024 Medicinal Chemistry Reviews 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3200152
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2849876
关于积分的说明 8070327
捐赠科研通 2513676
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1346578
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 640229
邀请新用户注册赠送积分活动 610154