Improved identification of Streptococcus bovis-Streptococcus equinus-complex species and subspecies by MALDI-TOF MS using a novel library

亚种 牛链球菌 鉴定(生物学) 微生物学 链球菌 物种鉴定 链球菌科 生物 医学 细菌 动物 遗传学 植物 食品科学 抗生素 瘤胃 发酵
作者
Jonas Öberg,Malin Inghammar,Bo Nilson
出处
期刊:Diagnostic Microbiology and Infectious Disease [Elsevier]
卷期号:107 (3): 116045-116045 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2023.116045
摘要

To develop an in-house matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) library for improved identification of species and subspecies of the Streptococcus bovis/Streptococcus equinus-complex (SBSEC). 236 SBSEC isolates from blood stream infections and culture collections, determined by whole genome sequencing to subspecies level, were grown in brain heart infusion broth. Mass spectra were collected using the Bruker MALDI Biotyper system after ethanol-formic acid extraction. Main spectral profiles from 117 isolates were used to create the "SBSEC-CMRS library". The remaining 119 spectra were used for evaluation of Bruker MBT Compass Library Revision K (2022) and the SBSEC-CMRS library. The Bruker library correctly identified species and subspecies in 72/119 (61 %) isolates, while the SBSEC-CMRS library identified 116/119 (97 %), using a cutoff score of ≥2.0. The SBSEC-CMRS library showed sufficient diagnostic accuracy, and can be implemented in clinical practice for SBSEC species and subspecies identification.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
zhangshuang应助文件撤销了驳回
1秒前
科研通AI2S应助wuchun采纳,获得10
1秒前
情怀应助西扬采纳,获得20
1秒前
2秒前
科研通AI2S应助虞丹萱采纳,获得10
2秒前
2秒前
商毛毛发布了新的文献求助10
3秒前
Abi完成签到,获得积分10
5秒前
加菲丰丰应助ccq采纳,获得20
5秒前
李鹏飞完成签到 ,获得积分10
6秒前
vv发布了新的文献求助10
6秒前
6秒前
Victoria发布了新的文献求助30
6秒前
7秒前
李爱国应助商毛毛采纳,获得10
7秒前
xk发布了新的文献求助10
8秒前
9秒前
11秒前
GONG完成签到,获得积分10
11秒前
可乐应助言文言采纳,获得10
12秒前
若离发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
阿乐完成签到,获得积分10
14秒前
顾矜应助科研通管家采纳,获得10
14秒前
小马甲应助科研通管家采纳,获得10
14秒前
niu发布了新的文献求助20
14秒前
NexusExplorer应助科研通管家采纳,获得10
14秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
14秒前
小蘑菇应助科研通管家采纳,获得10
14秒前
传奇3应助科研通管家采纳,获得10
14秒前
小马甲应助科研通管家采纳,获得10
15秒前
英姑应助科研通管家采纳,获得10
15秒前
英俊的铭应助科研通管家采纳,获得10
15秒前
咿咿呀呀发布了新的文献求助10
16秒前
16秒前
JiangHan发布了新的文献求助10
20秒前
21秒前
22秒前
Douglas完成签到,获得积分10
22秒前
johnny发布了新的文献求助10
23秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3185724
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2835978
关于积分的说明 8007258
捐赠科研通 2498506
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1333515
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636868
邀请新用户注册赠送积分活动 604637