Improved identification of Streptococcus bovis-Streptococcus equinus-complex species and subspecies by MALDI-TOF MS using a novel library

亚种 牛链球菌 鉴定(生物学) 微生物学 链球菌 物种鉴定 链球菌科 生物 医学 细菌 动物 遗传学 植物 食品科学 抗生素 瘤胃 发酵
作者
Jonas Öberg,Malin Inghammar,Bo Nilson
出处
期刊:Diagnostic Microbiology and Infectious Disease [Elsevier]
卷期号:107 (3): 116045-116045 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2023.116045
摘要

To develop an in-house matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) library for improved identification of species and subspecies of the Streptococcus bovis/Streptococcus equinus-complex (SBSEC). 236 SBSEC isolates from blood stream infections and culture collections, determined by whole genome sequencing to subspecies level, were grown in brain heart infusion broth. Mass spectra were collected using the Bruker MALDI Biotyper system after ethanol-formic acid extraction. Main spectral profiles from 117 isolates were used to create the "SBSEC-CMRS library". The remaining 119 spectra were used for evaluation of Bruker MBT Compass Library Revision K (2022) and the SBSEC-CMRS library. The Bruker library correctly identified species and subspecies in 72/119 (61 %) isolates, while the SBSEC-CMRS library identified 116/119 (97 %), using a cutoff score of ≥2.0. The SBSEC-CMRS library showed sufficient diagnostic accuracy, and can be implemented in clinical practice for SBSEC species and subspecies identification.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
12完成签到 ,获得积分10
1秒前
2秒前
chongchong2022完成签到,获得积分10
2秒前
3秒前
JM完成签到 ,获得积分10
3秒前
是明明啊发布了新的文献求助10
3秒前
小白菜完成签到,获得积分10
4秒前
请输入合法的昵称完成签到,获得积分10
4秒前
Doris完成签到,获得积分10
4秒前
yy发布了新的文献求助30
4秒前
4秒前
4秒前
5秒前
朴实映天发布了新的文献求助10
5秒前
无花果应助olosveh采纳,获得10
5秒前
5秒前
treeman完成签到,获得积分10
6秒前
Lignin完成签到,获得积分10
6秒前
shenghao发布了新的文献求助10
6秒前
在水一方应助乔治哇采纳,获得10
6秒前
9秒前
aprilvanilla应助强健的寒风采纳,获得20
9秒前
kkkkk发布了新的文献求助10
10秒前
1+1应助胡强采纳,获得10
10秒前
大鸡腿发布了新的文献求助10
10秒前
10秒前
11秒前
科研通AI2S应助flower采纳,获得10
12秒前
14秒前
宇文三德发布了新的文献求助10
15秒前
快点毕业吧完成签到,获得积分20
15秒前
16秒前
16秒前
18秒前
不鸭完成签到 ,获得积分10
19秒前
乔治哇发布了新的文献求助10
20秒前
dd发布了新的文献求助10
20秒前
Gauss应助UIN采纳,获得30
21秒前
kkkkk完成签到,获得积分20
22秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Write Like a Chemist: A Guide and Resource (第二版) 600
Mixed-anion Compounds 600
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
Earth System Geophysics 500
Aspects of Babylonian celestial divination: the lunar eclipse tablets of Enūma Anu Enlil 500
Geochemistry, 2nd Edition 地球化学经典教科书第二版 401
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3199896
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2849641
关于积分的说明 8069315
捐赠科研通 2513428
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1346276
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 640201
邀请新用户注册赠送积分活动 610072