Evaluation of an Antibiotic Cocktail for Fecal Microbiota Transplantation in Mouse

疣状疣 厚壁菌 拟杆菌 生物 肠道菌群 放线菌门 新霉素 粪便 抗生素 微生物学 氨苄西林 移植 内科学 免疫学 医学 细菌 16S核糖体RNA 遗传学
作者
Jijun Tan,Jiatai Gong,Feng‐Cheng Liu,Baizhen Li,Zhanfeng Li,Jiaming You,Jifeng He,Shusong Wu
出处
期刊:Frontiers in Nutrition [Frontiers Media SA]
卷期号:9 被引量:5
标识
DOI:10.3389/fnut.2022.918098
摘要

Objective This study aimed to evaluate the effect of an antibiotic cocktail on gut microbiota and provide a reference for establishing an available mouse model for fecal microbiota transplantation (FMT) of specific microbes. Design C57BL/6J mice ( n = 24) had free access to an antibiotic cocktail containing vancomycin (0.5 g/L), ampicillin (1 g/L), neomycin (1 g/L), and metronidazole (1 g/L) in drinking water for 3 weeks. Fecal microbiota was characterized by 16S rDNA gene sequencing at the beginning, 1st week, and 3rd week, respectively. The mice were then treated with fecal microbiota from normal mice for 1 week to verify the efficiency of FMT. Results The diversity of microbiota including chao1, observed species, phylogenetic diversity (PD) whole tree, and Shannon index were decreased significantly ( P < 0.05) after being treated with the antibiotic cocktail for 1 or 3 weeks. The relative abundance of Bacteroidetes , Actinobacteria , and Verrucomicrobia was decreased by 99.94, 92.09, and 100%, respectively, while Firmicutes dominated the microbiota at the phylum level after 3 weeks of treatment. Meanwhile, Lactococcus , a genus belonging to the phylum of Firmicutes dominated the microbiota at the genus level with a relative abundance of 80.63%. Further FMT experiment indicated that the fecal microbiota from the receptor mice had a similar composition to the donor mice after 1 week. Conclusion The antibiotic cocktail containing vancomycin, ampicillin, neomycin, and metronidazole eliminates microbes belonging to Bacteroidetes , Actinobacteria , and Verrucomicrobia , which can be recovered by FMT in mice.
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