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Algorithm for generating irreducible site-occupancy configurations

Fortran语言 不可约表示 格子(音乐) 计算机科学 超单元 占用率 分拆(数论) 编码(集合论) 对称(几何) 代表(政治) 基质(化学分析) 算法 物理 纯数学 组合数学 数学 几何学 化学 工程类 政治学 建筑工程 集合(抽象数据类型) 程序设计语言 法学 雷达 操作系统 政治 电信 色谱法 声学
作者
Ji‐Chun Lian,Hongyu Wu,Wei‐Qing Huang,Wangyu Hu,Gui‐Fang Huang
出处
期刊:Physical review [American Physical Society]
卷期号:102 (13) 被引量:26
标识
DOI:10.1103/physrevb.102.134209
摘要

Generating irreducible site-occupancy configurations by taking advantage of crystal symmetry is a ubiquitous method for accelerating of disordered structure prediction, which plays an important role in condensed matter physics and material science. Here, we present a new algorithm for generating irreducible site-occupancy configurations, that works for arbitrary parent cell with any supercell expansion matrix, and for any number of atom types with arbitrary stoichiometry. The new algorithm identifies the symmetrically equivalent configurations by searching the space group operations of underlying lattice and building the equivalent atomic matrix based on it. Importantly, an integer representation of configurations can greatly accelerate the speed of elimination of duplicate configurations, resulting into a linear scale of run time with the number of irreducible configurations that finally found. Moreover, based on our new algorithm, we write the corresponding code named as disorder in FORTRAN programming language, and the performance test results show that the time efficiency of our disorder code is superior to that of other related codes (supercell, enumlib and SOD).
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