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Genetic evaluation in indeterminate acute liver failure: A post hoc analysis

不确定 基因型 病因学 基因 医学 复合杂合度 表型 遗传学 生物 胃肠病学 内科学 数学 纯数学
作者
Chunya Wang,Meina Li,Zhenhua Liu,Yupeng Guo,Huijuan Liu,Pan Zhao
出处
期刊:Arab Journal of Gastroenterology [Elsevier]
标识
DOI:10.1016/j.ajg.2024.03.004
摘要

There are limited data regarding indeterminate acute liver failure (ALF). The study aims to perform a post hoc analysis using genetic methods for the ALF cases with indeterminate etiology. Stored blood samples from these patients with indeterminate ALF were collected. Whole-exome sequencing (WES) was used to evaluate the pathogenesis of indeterminate ALF. A total of 16 samples from 11 adult patients and 5 pediatric patients with indeterminate ALF were available. Among the adult patients, one female patient was identified with two heterozygous variants (c.2333G > T (p.Arg778Leu) and c.2310C > G (p.Leu770 = )) in the adenosine triphosphatase copper-transporting beta (ATP7B) gene, and two male patients were found to harbor heterozygous and homozygous variants (c.686C > A (p.Pro229Gln) plus homozygous variant A(TA)6TAAinsTA (-), and c.1456 T > G (p.Tyr486Asp) plus c.211G > A (p.Gly71Arg)) in the uridine diphosphate glucuronosyltransferase 1A1 (UGT1A1) gene. For the pediatric patients, single heterozygous variant (c.2890C > T (p.Arg964Cys)) in the polymerase gamma (POLG) gene was found in 1 male child, and two heterozygous variants (c.1909A > G (p.Lys637Glu) and c.3646G > A (p.Val1216Ile)) in the tetratricopeptide repeat domain 37 (TTC37) gene were found in 1 female child. No variants clinically associated with known liver diseases were revealed in the remaining patients. These results expand the knowledge of ALF with indeterminate etiology. WES is helpful to reveal possible candidate genes for indeterminate ALF, but incomplete consistency between the genotype and phenotype in some cases still challenge the accurate diagnosis.
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