Different epigenome regulation and transcriptome expression of CD4+ and CD8+ T cells from monozygotic twins discordant for psoriasis

表观基因组 银屑病 转录组 亚硫酸氢盐测序 遗传学 基因 单卵双胞胎 发病机制 DNA甲基化 表观遗传学 生物 医学 基因表达 免疫学
作者
Xiaofang Li,Xincheng Zhao,Jianxiao Xing,Shandong Li,Fusheng He,Ruixia Hou,Qiang Wang,Guohua Yin,Xinhua Li,Kaiming Zhang
出处
期刊:Australasian Journal of Dermatology [Wiley]
卷期号:61 (4) 被引量:7
标识
DOI:10.1111/ajd.13325
摘要

Psoriasis is an immunodeficient skin disorder, and its exact pathogenesis is unclear. Monozygotic twins are presumed to be genetically identical, and their phenotypic differences may be due to transcriptional regulation or epigenome factors. To explain the inconsistency between twins, we have collected 3 pairs of monozygotic twins who are discordant for psoriasis.Reduced representation of bisulfite sequencing and RNA sequencing was conducted using the peripheral blood of the twins to find the genes playing important roles in psoriasis pathogenesis.As a result, we found methylation diversity in four genes (MAST3, MTOR, PM20D1 and ZNF99), and we also found 9 differentially expressed genes (PPAN-P2RY11, PIGV, RPS18, TMEM121, KIF21A, KCNH2, WNT10B, PRX and CDH24) by RNA sequencing. According to the conjoint analysis of methylation and the mRNA results, PTPN6, CCL5, NFATC1 and PRF1 were found to be closely related to psoriasis. We then annotated the genes to explore the associations between these genes and psoriasis.These findings provide a better understanding of psoriasis that can improve the diagnosis and treatment of the disease.
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